Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SERINC1Q9NRX5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SERINC1Q9NRX5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SERINC1Q9NRX5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SERINC1Q9NRX5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERINC1Q9NRX5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERINC1Q9NRX5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERINC1Q9NRX5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERINC1Q9NRX5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERINC1Q9NRX5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERINC1Q9NRX5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERINC1Q9NRX5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SERINC1Q9NRX5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERINC1Q9NRX5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERINC1Q9NRX5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERINC1Q9NRX5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERINC1Q9NRX5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERINC1Q9NRX5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERINC1Q9NRX5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERINC1Q9NRX5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SERINC1Q9NRX5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SERINC1Q9NRX5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SERINC1Q9NRX5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SERINC1Q9NRX5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SERINC1Q9NRX5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SERINC1Q9NRX5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SERINC1Q9NRX5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERINC1Q9NRX5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERINC1Q9NRX5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SERINC1Q9NRX5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERINC1Q9NRX5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERINC1Q9NRX5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERINC1Q9NRX5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERINC1Q9NRX5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERINC1Q9NRX5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERINC1Q9NRX5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERINC1Q9NRX5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERINC1Q9NRX5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERINC1Q9NRX5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERINC1Q9NRX5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERINC1Q9NRX5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERINC1Q9NRX5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERINC1Q9NRX5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERINC1Q9NRX5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERINC1Q9NRX5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERINC1Q9NRX5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERINC1Q9NRX5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERINC1Q9NRX5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERINC1Q9NRX5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERINC1Q9NRX5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERINC1Q9NRX5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERINC1Q9NRX5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERINC1Q9NRX5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERINC1Q9NRX5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERINC1Q9NRX5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERINC1Q9NRX5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SERINC1Q9NRX5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SERINC1Q9NRX5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SERINC1Q9NRX5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SERINC1Q9NRX5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SERINC1Q9NRX5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SERINC1Q9NRX5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERINC1Q9NRX5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERINC1Q9NRX5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERINC1Q9NRX5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERINC1Q9NRX5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERINC1Q9NRX5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERINC1Q9NRX5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERINC1Q9NRX5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERINC1Q9NRX5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SERINC1Q9NRX5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERINC1Q9NRX5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERINC1Q9NRX5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERINC1Q9NRX5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SERINC1Q9NRX5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERINC1Q9NRX5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERINC1Q9NRX5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERINC1Q9NRX5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SERINC1Q9NRX5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SERINC1Q9NRX5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SERINC1Q9NRX5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SERINC1Q9NRX5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SERINC1Q9NRX5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SERINC1Q9NRX5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SERINC1Q9NRX5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SERINC1Q9NRX5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SERINC1Q9NRX5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SERINC1Q9NRX5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SERINC1Q9NRX5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SERINC1Q9NRX5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SERINC1Q9NRX5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SERINC1Q9NRX5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SERINC1Q9NRX5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SERINC1Q9NRX5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SERINC1Q9NRX5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SERINC1Q9NRX5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SERINC1Q9NRX5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SERINC1Q9NRX5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SERINC1Q9NRX5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SERINC1Q9NRX5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms