Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB6BQ9NRW1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB6BQ9NRW1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB6BQ9NRW1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB6BQ9NRW1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB6BQ9NRW1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB6BQ9NRW1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB6BQ9NRW1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB6BQ9NRW1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB6BQ9NRW1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB6BQ9NRW1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB6BQ9NRW1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB6BQ9NRW1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB6BQ9NRW1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB6BQ9NRW1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB6BQ9NRW1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB6BQ9NRW1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB6BQ9NRW1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB6BQ9NRW1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB6BQ9NRW1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB6BQ9NRW1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB6BQ9NRW1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB6BQ9NRW1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB6BQ9NRW1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RAB6BQ9NRW1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB6BQ9NRW1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB6BQ9NRW1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB6BQ9NRW1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB6BQ9NRW1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB6BQ9NRW1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB6BQ9NRW1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB6BQ9NRW1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB6BQ9NRW1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB6BQ9NRW1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB6BQ9NRW1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB6BQ9NRW1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB6BQ9NRW1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB6BQ9NRW1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB6BQ9NRW1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB6BQ9NRW1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB6BQ9NRW1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB6BQ9NRW1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB6BQ9NRW1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB6BQ9NRW1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB6BQ9NRW1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB6BQ9NRW1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB6BQ9NRW1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB6BQ9NRW1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB6BQ9NRW1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB6BQ9NRW1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB6BQ9NRW1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB6BQ9NRW1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB6BQ9NRW1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB6BQ9NRW1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB6BQ9NRW1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB6BQ9NRW1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB6BQ9NRW1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB6BQ9NRW1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB6BQ9NRW1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB6BQ9NRW1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB6BQ9NRW1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB6BQ9NRW1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB6BQ9NRW1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB6BQ9NRW1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB6BQ9NRW1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB6BQ9NRW1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB6BQ9NRW1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB6BQ9NRW1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB6BQ9NRW1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB6BQ9NRW1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB6BQ9NRW1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB6BQ9NRW1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB6BQ9NRW1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB6BQ9NRW1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB6BQ9NRW1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB6BQ9NRW1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB6BQ9NRW1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB6BQ9NRW1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB6BQ9NRW1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB6BQ9NRW1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB6BQ9NRW1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB6BQ9NRW1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB6BQ9NRW1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB6BQ9NRW1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB6BQ9NRW1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB6BQ9NRW1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB6BQ9NRW1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB6BQ9NRW1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB6BQ9NRW1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB6BQ9NRW1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB6BQ9NRW1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB6BQ9NRW1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB6BQ9NRW1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB6BQ9NRW1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB6BQ9NRW1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB6BQ9NRW1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB6BQ9NRW1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB6BQ9NRW1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB6BQ9NRW1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB6BQ9NRW1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms