Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR96

TLR9, Toll-like receptor 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR9Q9NR96 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TLR9Q9NR96 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TLR9Q9NR96 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TLR9Q9NR96 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TLR9Q9NR96 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TLR9Q9NR96 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TLR9Q9NR96 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TLR9Q9NR96 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TLR9Q9NR96 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TLR9Q9NR96 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TLR9Q9NR96 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TLR9Q9NR96 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TLR9Q9NR96 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TLR9Q9NR96 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TLR9Q9NR96 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TLR9Q9NR96 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TLR9Q9NR96 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TLR9Q9NR96 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TLR9Q9NR96 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TLR9Q9NR96 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TLR9Q9NR96 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TLR9Q9NR96 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TLR9Q9NR96 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TLR9Q9NR96 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TLR9Q9NR96 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TLR9Q9NR96 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TLR9Q9NR96 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TLR9Q9NR96 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TLR9Q9NR96 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TLR9Q9NR96 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TLR9Q9NR96 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TLR9Q9NR96 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TLR9Q9NR96 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TLR9Q9NR96 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TLR9Q9NR96 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TLR9Q9NR96 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TLR9Q9NR96 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TLR9Q9NR96 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TLR9Q9NR96 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TLR9Q9NR96 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TLR9Q9NR96 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TLR9Q9NR96 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TLR9Q9NR96 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TLR9Q9NR96 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TLR9Q9NR96 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TLR9Q9NR96 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TLR9Q9NR96 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TLR9Q9NR96 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TLR9Q9NR96 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TLR9Q9NR96 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TLR9Q9NR96 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TLR9Q9NR96 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TLR9Q9NR96 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TLR9Q9NR96 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TLR9Q9NR96 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TLR9Q9NR96 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TLR9Q9NR96 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TLR9Q9NR96 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TLR9Q9NR96 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TLR9Q9NR96 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TLR9Q9NR96 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TLR9Q9NR96 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TLR9Q9NR96 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TLR9Q9NR96 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TLR9Q9NR96 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TLR9Q9NR96 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TLR9Q9NR96 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TLR9Q9NR96 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TLR9Q9NR96 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TLR9Q9NR96 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TLR9Q9NR96 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TLR9Q9NR96 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TLR9Q9NR96 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TLR9Q9NR96 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TLR9Q9NR96 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TLR9Q9NR96 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TLR9Q9NR96 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TLR9Q9NR96 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TLR9Q9NR96 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TLR9Q9NR96 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TLR9Q9NR96 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TLR9Q9NR96 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TLR9Q9NR96 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TLR9Q9NR96 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TLR9Q9NR96 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TLR9Q9NR96 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TLR9Q9NR96 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TLR9Q9NR96 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TLR9Q9NR96 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TLR9Q9NR96 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TLR9Q9NR96 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TLR9Q9NR96 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TLR9Q9NR96 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TLR9Q9NR96 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TLR9Q9NR96 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TLR9Q9NR96 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TLR9Q9NR96 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TLR9Q9NR96 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TLR9Q9NR96 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TLR9Q9NR96 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms