Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BIN3Q9NQY0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BIN3Q9NQY0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BIN3Q9NQY0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BIN3Q9NQY0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BIN3Q9NQY0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BIN3Q9NQY0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BIN3Q9NQY0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BIN3Q9NQY0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BIN3Q9NQY0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BIN3Q9NQY0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BIN3Q9NQY0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BIN3Q9NQY0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BIN3Q9NQY0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BIN3Q9NQY0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BIN3Q9NQY0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BIN3Q9NQY0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BIN3Q9NQY0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BIN3Q9NQY0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BIN3Q9NQY0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BIN3Q9NQY0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BIN3Q9NQY0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BIN3Q9NQY0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BIN3Q9NQY0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BIN3Q9NQY0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BIN3Q9NQY0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BIN3Q9NQY0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BIN3Q9NQY0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BIN3Q9NQY0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BIN3Q9NQY0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BIN3Q9NQY0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BIN3Q9NQY0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BIN3Q9NQY0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BIN3Q9NQY0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BIN3Q9NQY0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BIN3Q9NQY0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BIN3Q9NQY0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BIN3Q9NQY0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BIN3Q9NQY0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BIN3Q9NQY0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BIN3Q9NQY0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BIN3Q9NQY0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BIN3Q9NQY0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BIN3Q9NQY0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BIN3Q9NQY0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BIN3Q9NQY0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BIN3Q9NQY0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BIN3Q9NQY0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BIN3Q9NQY0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BIN3Q9NQY0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BIN3Q9NQY0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BIN3Q9NQY0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BIN3Q9NQY0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BIN3Q9NQY0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BIN3Q9NQY0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BIN3Q9NQY0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BIN3Q9NQY0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BIN3Q9NQY0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BIN3Q9NQY0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BIN3Q9NQY0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BIN3Q9NQY0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BIN3Q9NQY0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
BIN3Q9NQY0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BIN3Q9NQY0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BIN3Q9NQY0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BIN3Q9NQY0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BIN3Q9NQY0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BIN3Q9NQY0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BIN3Q9NQY0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BIN3Q9NQY0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BIN3Q9NQY0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BIN3Q9NQY0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BIN3Q9NQY0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BIN3Q9NQY0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BIN3Q9NQY0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BIN3Q9NQY0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BIN3Q9NQY0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BIN3Q9NQY0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BIN3Q9NQY0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BIN3Q9NQY0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BIN3Q9NQY0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BIN3Q9NQY0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BIN3Q9NQY0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BIN3Q9NQY0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BIN3Q9NQY0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BIN3Q9NQY0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BIN3Q9NQY0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BIN3Q9NQY0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BIN3Q9NQY0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BIN3Q9NQY0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BIN3Q9NQY0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BIN3Q9NQY0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BIN3Q9NQY0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BIN3Q9NQY0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BIN3Q9NQY0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BIN3Q9NQY0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BIN3Q9NQY0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BIN3Q9NQY0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BIN3Q9NQY0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BIN3Q9NQY0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms