Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT4

EXOSC5, Exosome complex component RRP46, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC5Q9NQT4 ST7-OT4-202ENST00000397751 754 ntTSL 37.69□□□□□ -1.189e-7■■■■■ 38.3
EXOSC5Q9NQT4 ST7-217ENST00000446490 1694 ntTSL 57.03□□□□□ -1.289e-7■■■■■ 38.3
EXOSC5Q9NQT4 ST7-216ENST00000443979 805 ntTSL 56.54□□□□□ -1.369e-7■■■■■ 38.3
EXOSC5Q9NQT4 ST7-OT4-205ENST00000471110 591 ntTSL 44.36□□□□□ -1.719e-7■■■■■ 38.3
EXOSC5Q9NQT4 ST7-209ENST00000417919 577 ntTSL 44.21□□□□□ -1.749e-7■■■■■ 38.3
EXOSC5Q9NQT4 ST7-211ENST00000421345 531 ntTSL 43.93□□□□□ -1.789e-7■■■■■ 38.3
EXOSC5Q9NQT4 ST7-OT4-204ENST00000470996 416 ntTSL 23.63□□□□□ -1.839e-7■■■■■ 38.3
EXOSC5Q9NQT4 PTTG1IP-205ENST00000474737 580 ntTSL 312.49□□□□□ -0.411e-11■■■■■ 38.2
EXOSC5Q9NQT4 RABGAP1L-IT1-201ENST00000414890 737 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.073e-10■■■■■ 38.2
EXOSC5Q9NQT4 RABGAP1L-216ENST00000486220 772 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.363e-10■■■■■ 38.2
EXOSC5Q9NQT4 RABGAP1L-211ENST00000465412 710 ntTSL 56.18□□□□□ -1.423e-10■■■■■ 38.2
EXOSC5Q9NQT4 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.463e-10■■■■■ 38.2
EXOSC5Q9NQT4 RABGAP1L-214ENST00000478442 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.533e-10■■■■■ 38.2
EXOSC5Q9NQT4 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.563e-10■■■■■ 38.2
EXOSC5Q9NQT4 RABGAP1L-212ENST00000469553 2103 ntTSL 1 (best)5.17□□□□□ -1.583e-10■■■■■ 38.2
EXOSC5Q9NQT4 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.653e-10■■■■■ 38.2
EXOSC5Q9NQT4 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.673e-10■■■■■ 38.2
EXOSC5Q9NQT4 RABGAP1L-220ENST00000529145 722 ntTSL 44.45□□□□□ -1.73e-10■■■■■ 38.2
EXOSC5Q9NQT4 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.793e-10■■■■■ 38.2
EXOSC5Q9NQT4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.231e-9■■■■■ 38.2
EXOSC5Q9NQT4 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.131e-9■■■■■ 38.2
EXOSC5Q9NQT4 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.371e-9■■■■■ 38.2
EXOSC5Q9NQT4 ADK-201ENST00000286621 1169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.461e-9■■■■■ 38.2
EXOSC5Q9NQT4 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.567e-11■■■■■ 38.1
EXOSC5Q9NQT4 VAPB-204ENST00000475243 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.797e-11■■■■■ 38.1
EXOSC5Q9NQT4 VAPB-201ENST00000265619 3596 ntTSL 27.69□□□□□ -1.187e-11■■■■■ 38.1
EXOSC5Q9NQT4 VAPB-206ENST00000520497 937 ntTSL 27.23□□□□□ -1.257e-11■■■■■ 38.1
EXOSC5Q9NQT4 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.581e-7■■■■■ 38.1
EXOSC5Q9NQT4 CPED1-207ENST00000466055 543 ntTSL 35.02□□□□□ -1.611e-7■■■■■ 38.1
EXOSC5Q9NQT4 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.382e-8■■■■■ 38.1
EXOSC5Q9NQT4 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.412e-8■■■■■ 38.1
EXOSC5Q9NQT4 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.432e-8■■■■■ 38.1
EXOSC5Q9NQT4 PPP6R2-209ENST00000612753 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.582e-8■■■■■ 38.1
EXOSC5Q9NQT4 PPP6R2-201ENST00000216061 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.772e-8■■■■■ 38.1
EXOSC5Q9NQT4 FANCL-206ENST00000427708 864 ntTSL 510.8□□□□□ -0.681e-7■■■■■ 37.9
EXOSC5Q9NQT4 FANCL-205ENST00000417361 545 ntTSL 310.01□□□□□ -0.811e-7■■■■■ 37.9
EXOSC5Q9NQT4 FANCL-208ENST00000449070 964 ntTSL 1 (best)9.32□□□□□ -0.921e-7■■■■■ 37.9
EXOSC5Q9NQT4 FANCL-207ENST00000446381 487 ntTSL 58.51□□□□□ -1.051e-7■■■■■ 37.9
EXOSC5Q9NQT4 FANCL-204ENST00000403676 849 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.221e-7■■■■■ 37.9
EXOSC5Q9NQT4 FANCL-201ENST00000233741 1683 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.281e-7■■■■■ 37.9
EXOSC5Q9NQT4 FANCL-202ENST00000402135 1698 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.281e-7■■■■■ 37.9
EXOSC5Q9NQT4 FANCL-203ENST00000403295 1576 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.371e-7■■■■■ 37.9
EXOSC5Q9NQT4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.591e-7■■■■■ 37.9
EXOSC5Q9NQT4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.452e-7■■■■■ 37.7
EXOSC5Q9NQT4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.362e-7■■■■■ 37.7
EXOSC5Q9NQT4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.132e-7■■■■■ 37.7
EXOSC5Q9NQT4 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.232e-7■■■■■ 37.7
EXOSC5Q9NQT4 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.643e-7■■■■■ 37.7
EXOSC5Q9NQT4 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.93e-7■■■■■ 37.7
EXOSC5Q9NQT4 FYTTD1-202ENST00000412924 998 ntTSL 516.85■□□□□ 0.297e-7■■■■■ 37.7
EXOSC5Q9NQT4 FYTTD1-206ENST00000426031 491 ntTSL 316.12■□□□□ 0.177e-7■■■■■ 37.7
EXOSC5Q9NQT4 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.27e-7■■■■■ 37.7
EXOSC5Q9NQT4 FYTTD1-204ENST00000418169 593 ntTSL 58.36□□□□□ -1.077e-7■■■■■ 37.7
EXOSC5Q9NQT4 FYTTD1-203ENST00000415708 1342 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.177e-7■■■■■ 37.7
EXOSC5Q9NQT4 FYTTD1-209ENST00000494309 719 ntTSL 54.28□□□□□ -1.727e-7■■■■■ 37.7
EXOSC5Q9NQT4 FYTTD1-207ENST00000428738 718 ntTSL 53.06□□□□□ -1.927e-7■■■■■ 37.7
EXOSC5Q9NQT4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.982e-7■■■■■ 37.7
EXOSC5Q9NQT4 DTNBP1-211ENST00000515875 1306 ntTSL 520.31■□□□□ 0.842e-7■■■■■ 37.7
EXOSC5Q9NQT4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.752e-7■■■■■ 37.7
EXOSC5Q9NQT4 DTNBP1-208ENST00000511762 843 ntTSL 319.64■□□□□ 0.732e-7■■■■■ 37.7
EXOSC5Q9NQT4 DTNBP1-209ENST00000513680 1518 ntTSL 519.29■□□□□ 0.682e-7■■■■■ 37.7
EXOSC5Q9NQT4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.512e-7■■■■■ 37.7
EXOSC5Q9NQT4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.092e-7■■■■■ 37.7
EXOSC5Q9NQT4 DTNBP1-207ENST00000510395 1404 ntTSL 214.37□□□□□ -0.112e-7■■■■■ 37.7
EXOSC5Q9NQT4 DTNBP1-205ENST00000506844 1542 ntTSL 1 (best)13.34□□□□□ -0.272e-7■■■■■ 37.7
EXOSC5Q9NQT4 ARVCF-206ENST00000467828 258 ntTSL 314.98□□□□□ -0.017e-7■■■■■ 37.7
EXOSC5Q9NQT4 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.27e-7■■■■■ 37.7
EXOSC5Q9NQT4 ANO10-206ENST00000427171 746 ntTSL 513.17□□□□□ -0.39e-7■■■■■ 37.6
EXOSC5Q9NQT4 ANO10-207ENST00000428472 592 ntTSL 49.64□□□□□ -0.879e-7■■■■■ 37.6
EXOSC5Q9NQT4 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.592e-6■■■■■ 37.6
EXOSC5Q9NQT4 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.692e-6■■■■■ 37.6
EXOSC5Q9NQT4 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.732e-6■■■■■ 37.6
EXOSC5Q9NQT4 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.772e-6■■■■■ 37.6
EXOSC5Q9NQT4 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.782e-6■■■■■ 37.6
EXOSC5Q9NQT4 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.812e-6■■■■■ 37.6
EXOSC5Q9NQT4 NCK1-203ENST00000467911 581 ntTSL 34.62□□□□□ -1.671e-8■■■■■ 37.6
EXOSC5Q9NQT4 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.831e-8■■■■■ 37.6
EXOSC5Q9NQT4 NCK1-212ENST00000496489 422 ntTSL 32.76□□□□□ -1.971e-8■■■■■ 37.6
EXOSC5Q9NQT4 SIMC1-211ENST00000514128 697 ntTSL 219.02■□□□□ 0.648e-7■■■■■ 37.6
EXOSC5Q9NQT4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.68e-7■■■■■ 37.6
EXOSC5Q9NQT4 SIMC1-206ENST00000467472 364 ntTSL 518.72■□□□□ 0.598e-7■■■■■ 37.6
EXOSC5Q9NQT4 SIMC1-208ENST00000495423 913 ntTSL 218.72■□□□□ 0.598e-7■■■■■ 37.6
EXOSC5Q9NQT4 SIMC1-210ENST00000508769 461 ntTSL 318.37■□□□□ 0.538e-7■■■■■ 37.6
EXOSC5Q9NQT4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.528e-7■■■■■ 37.6
EXOSC5Q9NQT4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.48e-7■■■■■ 37.6
EXOSC5Q9NQT4 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.348e-7■■■■■ 37.6
EXOSC5Q9NQT4 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.163e-8■■■■■ 37.5
EXOSC5Q9NQT4 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.273e-8■■■■■ 37.5
EXOSC5Q9NQT4 KDM3A-206ENST00000452034 709 ntTSL 512.55□□□□□ -0.43e-8■■■■■ 37.5
EXOSC5Q9NQT4 KDM3A-204ENST00000427678 565 ntTSL 212.01□□□□□ -0.493e-8■■■■■ 37.5
EXOSC5Q9NQT4 KDM3A-216ENST00000542128 4311 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.63e-8■■■■■ 37.5
EXOSC5Q9NQT4 KDM3A-205ENST00000441719 8741 ntTSL 29.85□□□□□ -0.833e-8■■■■■ 37.5
EXOSC5Q9NQT4 KDM3A-202ENST00000409064 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.993e-8■■■■■ 37.5
EXOSC5Q9NQT4 KDM3A-215ENST00000498528 352 ntTSL 35.1□□□□□ -1.593e-8■■■■■ 37.5
EXOSC5Q9NQT4 ELF2-209ENST00000511184 1766 ntTSL 523.25■■□□□ 1.315e-8■■■■■ 37.5
EXOSC5Q9NQT4 ELF2-208ENST00000511006 1434 ntTSL 1 (best)18.7■□□□□ 0.585e-8■■■■■ 37.5
EXOSC5Q9NQT4 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.025e-8■■■■■ 37.5
EXOSC5Q9NQT4 NF1-205ENST00000456735 7787 ntTSL 55.42□□□□□ -1.544e-7■■■■■ 37.5
EXOSC5Q9NQT4 NF1-215ENST00000493220 5691 ntTSL 25.35□□□□□ -1.554e-7■■■■■ 37.5
EXOSC5Q9NQT4 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.178e-10■■■■■ 37.5
Retrieved 100 of 8,799 protein–RNA pairs in 128 ms