Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR4

NIT2, Omega-amidase NIT2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIT2Q9NQR4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIT2Q9NQR4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIT2Q9NQR4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIT2Q9NQR4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIT2Q9NQR4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIT2Q9NQR4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIT2Q9NQR4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIT2Q9NQR4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIT2Q9NQR4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIT2Q9NQR4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIT2Q9NQR4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIT2Q9NQR4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIT2Q9NQR4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIT2Q9NQR4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIT2Q9NQR4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NIT2Q9NQR4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIT2Q9NQR4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIT2Q9NQR4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIT2Q9NQR4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIT2Q9NQR4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIT2Q9NQR4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIT2Q9NQR4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIT2Q9NQR4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIT2Q9NQR4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIT2Q9NQR4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIT2Q9NQR4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIT2Q9NQR4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIT2Q9NQR4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIT2Q9NQR4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIT2Q9NQR4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIT2Q9NQR4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIT2Q9NQR4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIT2Q9NQR4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIT2Q9NQR4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIT2Q9NQR4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIT2Q9NQR4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIT2Q9NQR4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIT2Q9NQR4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NIT2Q9NQR4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIT2Q9NQR4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIT2Q9NQR4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIT2Q9NQR4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIT2Q9NQR4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIT2Q9NQR4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIT2Q9NQR4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIT2Q9NQR4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIT2Q9NQR4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIT2Q9NQR4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIT2Q9NQR4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIT2Q9NQR4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIT2Q9NQR4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIT2Q9NQR4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIT2Q9NQR4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIT2Q9NQR4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIT2Q9NQR4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIT2Q9NQR4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIT2Q9NQR4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIT2Q9NQR4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIT2Q9NQR4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NIT2Q9NQR4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NIT2Q9NQR4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NIT2Q9NQR4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NIT2Q9NQR4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NIT2Q9NQR4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NIT2Q9NQR4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIT2Q9NQR4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIT2Q9NQR4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIT2Q9NQR4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIT2Q9NQR4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIT2Q9NQR4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIT2Q9NQR4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIT2Q9NQR4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIT2Q9NQR4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIT2Q9NQR4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIT2Q9NQR4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIT2Q9NQR4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIT2Q9NQR4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIT2Q9NQR4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIT2Q9NQR4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIT2Q9NQR4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIT2Q9NQR4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIT2Q9NQR4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIT2Q9NQR4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIT2Q9NQR4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIT2Q9NQR4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIT2Q9NQR4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIT2Q9NQR4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIT2Q9NQR4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIT2Q9NQR4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NIT2Q9NQR4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIT2Q9NQR4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIT2Q9NQR4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIT2Q9NQR4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIT2Q9NQR4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIT2Q9NQR4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIT2Q9NQR4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIT2Q9NQR4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIT2Q9NQR4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIT2Q9NQR4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIT2Q9NQR4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms