Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQH7

XPNPEP3, Probable Xaa-Pro aminopeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPNPEP3Q9NQH7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
XPNPEP3Q9NQH7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
XPNPEP3Q9NQH7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
XPNPEP3Q9NQH7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
XPNPEP3Q9NQH7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
XPNPEP3Q9NQH7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
XPNPEP3Q9NQH7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28■■■□□ 2.07
XPNPEP3Q9NQH7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
XPNPEP3Q9NQH7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
XPNPEP3Q9NQH7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
XPNPEP3Q9NQH7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
XPNPEP3Q9NQH7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
XPNPEP3Q9NQH7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
XPNPEP3Q9NQH7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
XPNPEP3Q9NQH7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
XPNPEP3Q9NQH7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
XPNPEP3Q9NQH7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
XPNPEP3Q9NQH7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
XPNPEP3Q9NQH7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
XPNPEP3Q9NQH7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
XPNPEP3Q9NQH7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
XPNPEP3Q9NQH7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
XPNPEP3Q9NQH7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
XPNPEP3Q9NQH7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
XPNPEP3Q9NQH7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
XPNPEP3Q9NQH7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
XPNPEP3Q9NQH7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
XPNPEP3Q9NQH7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
XPNPEP3Q9NQH7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
XPNPEP3Q9NQH7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
XPNPEP3Q9NQH7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
XPNPEP3Q9NQH7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
XPNPEP3Q9NQH7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
XPNPEP3Q9NQH7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
XPNPEP3Q9NQH7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
XPNPEP3Q9NQH7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
XPNPEP3Q9NQH7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
XPNPEP3Q9NQH7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
XPNPEP3Q9NQH7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
XPNPEP3Q9NQH7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
XPNPEP3Q9NQH7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
XPNPEP3Q9NQH7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
XPNPEP3Q9NQH7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
XPNPEP3Q9NQH7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
XPNPEP3Q9NQH7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
XPNPEP3Q9NQH7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
XPNPEP3Q9NQH7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
XPNPEP3Q9NQH7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
XPNPEP3Q9NQH7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
XPNPEP3Q9NQH7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
XPNPEP3Q9NQH7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
XPNPEP3Q9NQH7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
XPNPEP3Q9NQH7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
XPNPEP3Q9NQH7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
XPNPEP3Q9NQH7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
XPNPEP3Q9NQH7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
XPNPEP3Q9NQH7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
XPNPEP3Q9NQH7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
XPNPEP3Q9NQH7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
XPNPEP3Q9NQH7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
XPNPEP3Q9NQH7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.9 ms