Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQH7

XPNPEP3, Probable Xaa-Pro aminopeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPNPEP3Q9NQH7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
XPNPEP3Q9NQH7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
XPNPEP3Q9NQH7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
XPNPEP3Q9NQH7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
XPNPEP3Q9NQH7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
XPNPEP3Q9NQH7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
XPNPEP3Q9NQH7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28■■■□□ 2.07
XPNPEP3Q9NQH7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
XPNPEP3Q9NQH7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
XPNPEP3Q9NQH7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
XPNPEP3Q9NQH7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
XPNPEP3Q9NQH7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
XPNPEP3Q9NQH7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
XPNPEP3Q9NQH7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
XPNPEP3Q9NQH7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
XPNPEP3Q9NQH7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
XPNPEP3Q9NQH7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
XPNPEP3Q9NQH7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
XPNPEP3Q9NQH7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
XPNPEP3Q9NQH7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
XPNPEP3Q9NQH7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
XPNPEP3Q9NQH7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
XPNPEP3Q9NQH7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
XPNPEP3Q9NQH7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
XPNPEP3Q9NQH7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
XPNPEP3Q9NQH7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
XPNPEP3Q9NQH7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
XPNPEP3Q9NQH7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
XPNPEP3Q9NQH7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
XPNPEP3Q9NQH7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
XPNPEP3Q9NQH7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
XPNPEP3Q9NQH7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
XPNPEP3Q9NQH7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
XPNPEP3Q9NQH7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
XPNPEP3Q9NQH7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
XPNPEP3Q9NQH7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
XPNPEP3Q9NQH7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
XPNPEP3Q9NQH7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
XPNPEP3Q9NQH7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
XPNPEP3Q9NQH7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
XPNPEP3Q9NQH7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
XPNPEP3Q9NQH7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
XPNPEP3Q9NQH7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
XPNPEP3Q9NQH7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
XPNPEP3Q9NQH7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
XPNPEP3Q9NQH7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
XPNPEP3Q9NQH7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
XPNPEP3Q9NQH7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
XPNPEP3Q9NQH7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
XPNPEP3Q9NQH7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
XPNPEP3Q9NQH7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
XPNPEP3Q9NQH7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
XPNPEP3Q9NQH7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
XPNPEP3Q9NQH7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
XPNPEP3Q9NQH7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
XPNPEP3Q9NQH7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
XPNPEP3Q9NQH7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
XPNPEP3Q9NQH7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
XPNPEP3Q9NQH7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
XPNPEP3Q9NQH7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
XPNPEP3Q9NQH7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
XPNPEP3Q9NQH7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms