Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ50

MRPL40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL40Q9NQ50 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MRPL40Q9NQ50 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MRPL40Q9NQ50 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MRPL40Q9NQ50 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MRPL40Q9NQ50 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MRPL40Q9NQ50 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MRPL40Q9NQ50 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MRPL40Q9NQ50 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MRPL40Q9NQ50 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MRPL40Q9NQ50 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MRPL40Q9NQ50 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MRPL40Q9NQ50 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MRPL40Q9NQ50 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MRPL40Q9NQ50 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MRPL40Q9NQ50 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MRPL40Q9NQ50 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MRPL40Q9NQ50 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MRPL40Q9NQ50 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MRPL40Q9NQ50 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MRPL40Q9NQ50 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MRPL40Q9NQ50 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MRPL40Q9NQ50 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MRPL40Q9NQ50 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MRPL40Q9NQ50 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MRPL40Q9NQ50 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MRPL40Q9NQ50 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MRPL40Q9NQ50 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MRPL40Q9NQ50 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MRPL40Q9NQ50 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MRPL40Q9NQ50 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MRPL40Q9NQ50 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MRPL40Q9NQ50 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MRPL40Q9NQ50 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MRPL40Q9NQ50 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MRPL40Q9NQ50 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MRPL40Q9NQ50 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MRPL40Q9NQ50 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MRPL40Q9NQ50 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MRPL40Q9NQ50 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MRPL40Q9NQ50 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MRPL40Q9NQ50 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MRPL40Q9NQ50 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MRPL40Q9NQ50 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MRPL40Q9NQ50 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MRPL40Q9NQ50 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MRPL40Q9NQ50 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MRPL40Q9NQ50 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MRPL40Q9NQ50 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MRPL40Q9NQ50 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MRPL40Q9NQ50 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MRPL40Q9NQ50 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MRPL40Q9NQ50 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MRPL40Q9NQ50 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MRPL40Q9NQ50 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MRPL40Q9NQ50 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MRPL40Q9NQ50 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MRPL40Q9NQ50 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MRPL40Q9NQ50 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MRPL40Q9NQ50 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MRPL40Q9NQ50 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MRPL40Q9NQ50 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MRPL40Q9NQ50 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MRPL40Q9NQ50 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRPL40Q9NQ50 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRPL40Q9NQ50 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRPL40Q9NQ50 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRPL40Q9NQ50 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRPL40Q9NQ50 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRPL40Q9NQ50 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRPL40Q9NQ50 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRPL40Q9NQ50 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRPL40Q9NQ50 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MRPL40Q9NQ50 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MRPL40Q9NQ50 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MRPL40Q9NQ50 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MRPL40Q9NQ50 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MRPL40Q9NQ50 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MRPL40Q9NQ50 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MRPL40Q9NQ50 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRPL40Q9NQ50 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRPL40Q9NQ50 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRPL40Q9NQ50 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRPL40Q9NQ50 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRPL40Q9NQ50 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRPL40Q9NQ50 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRPL40Q9NQ50 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPL40Q9NQ50 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPL40Q9NQ50 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPL40Q9NQ50 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPL40Q9NQ50 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPL40Q9NQ50 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPL40Q9NQ50 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPL40Q9NQ50 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPL40Q9NQ50 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRPL40Q9NQ50 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRPL40Q9NQ50 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRPL40Q9NQ50 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRPL40Q9NQ50 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRPL40Q9NQ50 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRPL40Q9NQ50 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101 ms