Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE6

SPAG4, Sperm-associated antigen 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG4Q9NPE6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPAG4Q9NPE6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPAG4Q9NPE6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPAG4Q9NPE6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPAG4Q9NPE6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPAG4Q9NPE6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPAG4Q9NPE6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SPAG4Q9NPE6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPAG4Q9NPE6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPAG4Q9NPE6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPAG4Q9NPE6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPAG4Q9NPE6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPAG4Q9NPE6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPAG4Q9NPE6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPAG4Q9NPE6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPAG4Q9NPE6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPAG4Q9NPE6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPAG4Q9NPE6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPAG4Q9NPE6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPAG4Q9NPE6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPAG4Q9NPE6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPAG4Q9NPE6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPAG4Q9NPE6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPAG4Q9NPE6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPAG4Q9NPE6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPAG4Q9NPE6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPAG4Q9NPE6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPAG4Q9NPE6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPAG4Q9NPE6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
SPAG4Q9NPE6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPAG4Q9NPE6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPAG4Q9NPE6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPAG4Q9NPE6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPAG4Q9NPE6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPAG4Q9NPE6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPAG4Q9NPE6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SPAG4Q9NPE6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPAG4Q9NPE6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPAG4Q9NPE6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPAG4Q9NPE6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SPAG4Q9NPE6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPAG4Q9NPE6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPAG4Q9NPE6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPAG4Q9NPE6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPAG4Q9NPE6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPAG4Q9NPE6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPAG4Q9NPE6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPAG4Q9NPE6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPAG4Q9NPE6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPAG4Q9NPE6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPAG4Q9NPE6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPAG4Q9NPE6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPAG4Q9NPE6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPAG4Q9NPE6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPAG4Q9NPE6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPAG4Q9NPE6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPAG4Q9NPE6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPAG4Q9NPE6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPAG4Q9NPE6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPAG4Q9NPE6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPAG4Q9NPE6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPAG4Q9NPE6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPAG4Q9NPE6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPAG4Q9NPE6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPAG4Q9NPE6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPAG4Q9NPE6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPAG4Q9NPE6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPAG4Q9NPE6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPAG4Q9NPE6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPAG4Q9NPE6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SPAG4Q9NPE6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPAG4Q9NPE6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPAG4Q9NPE6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPAG4Q9NPE6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPAG4Q9NPE6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPAG4Q9NPE6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPAG4Q9NPE6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SPAG4Q9NPE6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SPAG4Q9NPE6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SPAG4Q9NPE6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPAG4Q9NPE6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPAG4Q9NPE6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SPAG4Q9NPE6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPAG4Q9NPE6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPAG4Q9NPE6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPAG4Q9NPE6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPAG4Q9NPE6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPAG4Q9NPE6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPAG4Q9NPE6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPAG4Q9NPE6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPAG4Q9NPE6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPAG4Q9NPE6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPAG4Q9NPE6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPAG4Q9NPE6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPAG4Q9NPE6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPAG4Q9NPE6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPAG4Q9NPE6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPAG4Q9NPE6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPAG4Q9NPE6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPAG4Q9NPE6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms