Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A4GALTQ9NPC4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A4GALTQ9NPC4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A4GALTQ9NPC4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A4GALTQ9NPC4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A4GALTQ9NPC4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A4GALTQ9NPC4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A4GALTQ9NPC4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A4GALTQ9NPC4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A4GALTQ9NPC4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A4GALTQ9NPC4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A4GALTQ9NPC4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A4GALTQ9NPC4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A4GALTQ9NPC4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A4GALTQ9NPC4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A4GALTQ9NPC4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A4GALTQ9NPC4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A4GALTQ9NPC4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
A4GALTQ9NPC4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
A4GALTQ9NPC4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
A4GALTQ9NPC4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
A4GALTQ9NPC4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
A4GALTQ9NPC4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
A4GALTQ9NPC4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
A4GALTQ9NPC4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
A4GALTQ9NPC4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
A4GALTQ9NPC4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A4GALTQ9NPC4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A4GALTQ9NPC4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A4GALTQ9NPC4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A4GALTQ9NPC4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A4GALTQ9NPC4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A4GALTQ9NPC4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A4GALTQ9NPC4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A4GALTQ9NPC4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A4GALTQ9NPC4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A4GALTQ9NPC4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A4GALTQ9NPC4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A4GALTQ9NPC4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A4GALTQ9NPC4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A4GALTQ9NPC4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A4GALTQ9NPC4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A4GALTQ9NPC4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A4GALTQ9NPC4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A4GALTQ9NPC4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A4GALTQ9NPC4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A4GALTQ9NPC4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A4GALTQ9NPC4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A4GALTQ9NPC4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A4GALTQ9NPC4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A4GALTQ9NPC4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A4GALTQ9NPC4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A4GALTQ9NPC4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A4GALTQ9NPC4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A4GALTQ9NPC4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A4GALTQ9NPC4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A4GALTQ9NPC4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A4GALTQ9NPC4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
A4GALTQ9NPC4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A4GALTQ9NPC4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A4GALTQ9NPC4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A4GALTQ9NPC4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A4GALTQ9NPC4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A4GALTQ9NPC4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A4GALTQ9NPC4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A4GALTQ9NPC4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A4GALTQ9NPC4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
A4GALTQ9NPC4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
A4GALTQ9NPC4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A4GALTQ9NPC4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A4GALTQ9NPC4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
A4GALTQ9NPC4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
A4GALTQ9NPC4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A4GALTQ9NPC4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A4GALTQ9NPC4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
A4GALTQ9NPC4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A4GALTQ9NPC4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
A4GALTQ9NPC4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
A4GALTQ9NPC4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
A4GALTQ9NPC4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A4GALTQ9NPC4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A4GALTQ9NPC4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A4GALTQ9NPC4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A4GALTQ9NPC4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A4GALTQ9NPC4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A4GALTQ9NPC4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A4GALTQ9NPC4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A4GALTQ9NPC4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A4GALTQ9NPC4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A4GALTQ9NPC4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A4GALTQ9NPC4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A4GALTQ9NPC4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A4GALTQ9NPC4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A4GALTQ9NPC4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A4GALTQ9NPC4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A4GALTQ9NPC4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A4GALTQ9NPC4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A4GALTQ9NPC4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A4GALTQ9NPC4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A4GALTQ9NPC4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms