Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GPCPD1Q9NPB8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GPCPD1Q9NPB8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GPCPD1Q9NPB8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
GPCPD1Q9NPB8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GPCPD1Q9NPB8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
GPCPD1Q9NPB8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
GPCPD1Q9NPB8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GPCPD1Q9NPB8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GPCPD1Q9NPB8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GPCPD1Q9NPB8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GPCPD1Q9NPB8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GPCPD1Q9NPB8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GPCPD1Q9NPB8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GPCPD1Q9NPB8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GPCPD1Q9NPB8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GPCPD1Q9NPB8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GPCPD1Q9NPB8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GPCPD1Q9NPB8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GPCPD1Q9NPB8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GPCPD1Q9NPB8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GPCPD1Q9NPB8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GPCPD1Q9NPB8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GPCPD1Q9NPB8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GPCPD1Q9NPB8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
GPCPD1Q9NPB8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GPCPD1Q9NPB8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GPCPD1Q9NPB8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GPCPD1Q9NPB8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GPCPD1Q9NPB8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GPCPD1Q9NPB8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GPCPD1Q9NPB8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GPCPD1Q9NPB8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GPCPD1Q9NPB8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
GPCPD1Q9NPB8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GPCPD1Q9NPB8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
GPCPD1Q9NPB8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
GPCPD1Q9NPB8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GPCPD1Q9NPB8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GPCPD1Q9NPB8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
GPCPD1Q9NPB8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GPCPD1Q9NPB8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GPCPD1Q9NPB8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GPCPD1Q9NPB8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GPCPD1Q9NPB8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GPCPD1Q9NPB8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GPCPD1Q9NPB8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
GPCPD1Q9NPB8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GPCPD1Q9NPB8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GPCPD1Q9NPB8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GPCPD1Q9NPB8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GPCPD1Q9NPB8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GPCPD1Q9NPB8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GPCPD1Q9NPB8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GPCPD1Q9NPB8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GPCPD1Q9NPB8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GPCPD1Q9NPB8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
GPCPD1Q9NPB8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GPCPD1Q9NPB8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GPCPD1Q9NPB8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GPCPD1Q9NPB8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GPCPD1Q9NPB8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
GPCPD1Q9NPB8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GPCPD1Q9NPB8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GPCPD1Q9NPB8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
GPCPD1Q9NPB8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GPCPD1Q9NPB8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
GPCPD1Q9NPB8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GPCPD1Q9NPB8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GPCPD1Q9NPB8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GPCPD1Q9NPB8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
GPCPD1Q9NPB8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GPCPD1Q9NPB8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GPCPD1Q9NPB8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GPCPD1Q9NPB8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
GPCPD1Q9NPB8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GPCPD1Q9NPB8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GPCPD1Q9NPB8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GPCPD1Q9NPB8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GPCPD1Q9NPB8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GPCPD1Q9NPB8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GPCPD1Q9NPB8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GPCPD1Q9NPB8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GPCPD1Q9NPB8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GPCPD1Q9NPB8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
GPCPD1Q9NPB8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GPCPD1Q9NPB8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GPCPD1Q9NPB8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
GPCPD1Q9NPB8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GPCPD1Q9NPB8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GPCPD1Q9NPB8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GPCPD1Q9NPB8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
GPCPD1Q9NPB8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
GPCPD1Q9NPB8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GPCPD1Q9NPB8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GPCPD1Q9NPB8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GPCPD1Q9NPB8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GPCPD1Q9NPB8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GPCPD1Q9NPB8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GPCPD1Q9NPB8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms