Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PNPLA8Q9NP80 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PNPLA8Q9NP80 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PNPLA8Q9NP80 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PNPLA8Q9NP80 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PNPLA8Q9NP80 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PNPLA8Q9NP80 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PNPLA8Q9NP80 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PNPLA8Q9NP80 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PNPLA8Q9NP80 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PNPLA8Q9NP80 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PNPLA8Q9NP80 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PNPLA8Q9NP80 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PNPLA8Q9NP80 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PNPLA8Q9NP80 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PNPLA8Q9NP80 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PNPLA8Q9NP80 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PNPLA8Q9NP80 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PNPLA8Q9NP80 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PNPLA8Q9NP80 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PNPLA8Q9NP80 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PNPLA8Q9NP80 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PNPLA8Q9NP80 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PNPLA8Q9NP80 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PNPLA8Q9NP80 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PNPLA8Q9NP80 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PNPLA8Q9NP80 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PNPLA8Q9NP80 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PNPLA8Q9NP80 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PNPLA8Q9NP80 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PNPLA8Q9NP80 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PNPLA8Q9NP80 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PNPLA8Q9NP80 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PNPLA8Q9NP80 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PNPLA8Q9NP80 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PNPLA8Q9NP80 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PNPLA8Q9NP80 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PNPLA8Q9NP80 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PNPLA8Q9NP80 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PNPLA8Q9NP80 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PNPLA8Q9NP80 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PNPLA8Q9NP80 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PNPLA8Q9NP80 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PNPLA8Q9NP80 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PNPLA8Q9NP80 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PNPLA8Q9NP80 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PNPLA8Q9NP80 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PNPLA8Q9NP80 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PNPLA8Q9NP80 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PNPLA8Q9NP80 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PNPLA8Q9NP80 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PNPLA8Q9NP80 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PNPLA8Q9NP80 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PNPLA8Q9NP80 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PNPLA8Q9NP80 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PNPLA8Q9NP80 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PNPLA8Q9NP80 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PNPLA8Q9NP80 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PNPLA8Q9NP80 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PNPLA8Q9NP80 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PNPLA8Q9NP80 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PNPLA8Q9NP80 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PNPLA8Q9NP80 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PNPLA8Q9NP80 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PNPLA8Q9NP80 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PNPLA8Q9NP80 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PNPLA8Q9NP80 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PNPLA8Q9NP80 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PNPLA8Q9NP80 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PNPLA8Q9NP80 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PNPLA8Q9NP80 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PNPLA8Q9NP80 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PNPLA8Q9NP80 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PNPLA8Q9NP80 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PNPLA8Q9NP80 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PNPLA8Q9NP80 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PNPLA8Q9NP80 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PNPLA8Q9NP80 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PNPLA8Q9NP80 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PNPLA8Q9NP80 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PNPLA8Q9NP80 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PNPLA8Q9NP80 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PNPLA8Q9NP80 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PNPLA8Q9NP80 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PNPLA8Q9NP80 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PNPLA8Q9NP80 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PNPLA8Q9NP80 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PNPLA8Q9NP80 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PNPLA8Q9NP80 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PNPLA8Q9NP80 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PNPLA8Q9NP80 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PNPLA8Q9NP80 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PNPLA8Q9NP80 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PNPLA8Q9NP80 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PNPLA8Q9NP80 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PNPLA8Q9NP80 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PNPLA8Q9NP80 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PNPLA8Q9NP80 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PNPLA8Q9NP80 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PNPLA8Q9NP80 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms