Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP08

HMX1, Homeobox protein HMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX1Q9NP08 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HMX1Q9NP08 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HMX1Q9NP08 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HMX1Q9NP08 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HMX1Q9NP08 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HMX1Q9NP08 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HMX1Q9NP08 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HMX1Q9NP08 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HMX1Q9NP08 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HMX1Q9NP08 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HMX1Q9NP08 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HMX1Q9NP08 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HMX1Q9NP08 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HMX1Q9NP08 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HMX1Q9NP08 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HMX1Q9NP08 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HMX1Q9NP08 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HMX1Q9NP08 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HMX1Q9NP08 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
HMX1Q9NP08 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HMX1Q9NP08 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
HMX1Q9NP08 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HMX1Q9NP08 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
HMX1Q9NP08 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HMX1Q9NP08 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HMX1Q9NP08 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HMX1Q9NP08 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HMX1Q9NP08 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HMX1Q9NP08 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
HMX1Q9NP08 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HMX1Q9NP08 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HMX1Q9NP08 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HMX1Q9NP08 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HMX1Q9NP08 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
HMX1Q9NP08 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HMX1Q9NP08 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HMX1Q9NP08 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HMX1Q9NP08 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HMX1Q9NP08 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HMX1Q9NP08 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HMX1Q9NP08 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HMX1Q9NP08 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HMX1Q9NP08 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HMX1Q9NP08 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HMX1Q9NP08 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HMX1Q9NP08 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HMX1Q9NP08 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HMX1Q9NP08 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HMX1Q9NP08 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HMX1Q9NP08 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HMX1Q9NP08 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HMX1Q9NP08 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HMX1Q9NP08 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HMX1Q9NP08 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HMX1Q9NP08 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HMX1Q9NP08 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HMX1Q9NP08 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HMX1Q9NP08 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HMX1Q9NP08 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HMX1Q9NP08 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HMX1Q9NP08 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HMX1Q9NP08 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
HMX1Q9NP08 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HMX1Q9NP08 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HMX1Q9NP08 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HMX1Q9NP08 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HMX1Q9NP08 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HMX1Q9NP08 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HMX1Q9NP08 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HMX1Q9NP08 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HMX1Q9NP08 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HMX1Q9NP08 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HMX1Q9NP08 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
HMX1Q9NP08 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HMX1Q9NP08 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
HMX1Q9NP08 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HMX1Q9NP08 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HMX1Q9NP08 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HMX1Q9NP08 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HMX1Q9NP08 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HMX1Q9NP08 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HMX1Q9NP08 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HMX1Q9NP08 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HMX1Q9NP08 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HMX1Q9NP08 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HMX1Q9NP08 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HMX1Q9NP08 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HMX1Q9NP08 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HMX1Q9NP08 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HMX1Q9NP08 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HMX1Q9NP08 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HMX1Q9NP08 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HMX1Q9NP08 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HMX1Q9NP08 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
HMX1Q9NP08 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HMX1Q9NP08 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HMX1Q9NP08 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HMX1Q9NP08 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HMX1Q9NP08 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
HMX1Q9NP08 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms