Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCN3

TMEM8A, Post-GPI attachment to proteins factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM8AQ9HCN3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM8AQ9HCN3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM8AQ9HCN3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM8AQ9HCN3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM8AQ9HCN3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM8AQ9HCN3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM8AQ9HCN3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM8AQ9HCN3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM8AQ9HCN3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM8AQ9HCN3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM8AQ9HCN3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM8AQ9HCN3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM8AQ9HCN3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM8AQ9HCN3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM8AQ9HCN3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM8AQ9HCN3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM8AQ9HCN3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM8AQ9HCN3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM8AQ9HCN3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM8AQ9HCN3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM8AQ9HCN3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM8AQ9HCN3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM8AQ9HCN3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM8AQ9HCN3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM8AQ9HCN3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM8AQ9HCN3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM8AQ9HCN3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM8AQ9HCN3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM8AQ9HCN3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM8AQ9HCN3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM8AQ9HCN3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM8AQ9HCN3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM8AQ9HCN3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM8AQ9HCN3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM8AQ9HCN3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM8AQ9HCN3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM8AQ9HCN3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM8AQ9HCN3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM8AQ9HCN3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM8AQ9HCN3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM8AQ9HCN3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM8AQ9HCN3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM8AQ9HCN3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM8AQ9HCN3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM8AQ9HCN3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM8AQ9HCN3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM8AQ9HCN3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM8AQ9HCN3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM8AQ9HCN3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM8AQ9HCN3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM8AQ9HCN3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM8AQ9HCN3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TMEM8AQ9HCN3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TMEM8AQ9HCN3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMEM8AQ9HCN3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMEM8AQ9HCN3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMEM8AQ9HCN3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM8AQ9HCN3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM8AQ9HCN3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM8AQ9HCN3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM8AQ9HCN3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM8AQ9HCN3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM8AQ9HCN3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM8AQ9HCN3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM8AQ9HCN3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM8AQ9HCN3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM8AQ9HCN3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM8AQ9HCN3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM8AQ9HCN3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM8AQ9HCN3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM8AQ9HCN3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM8AQ9HCN3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM8AQ9HCN3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM8AQ9HCN3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMEM8AQ9HCN3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMEM8AQ9HCN3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMEM8AQ9HCN3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMEM8AQ9HCN3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMEM8AQ9HCN3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMEM8AQ9HCN3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMEM8AQ9HCN3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMEM8AQ9HCN3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TMEM8AQ9HCN3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TMEM8AQ9HCN3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM8AQ9HCN3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM8AQ9HCN3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM8AQ9HCN3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM8AQ9HCN3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMEM8AQ9HCN3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMEM8AQ9HCN3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMEM8AQ9HCN3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMEM8AQ9HCN3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMEM8AQ9HCN3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMEM8AQ9HCN3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TMEM8AQ9HCN3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMEM8AQ9HCN3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMEM8AQ9HCN3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMEM8AQ9HCN3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMEM8AQ9HCN3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMEM8AQ9HCN3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms