Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PLXNA4Q9HCM2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PLXNA4Q9HCM2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PLXNA4Q9HCM2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PLXNA4Q9HCM2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLXNA4Q9HCM2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLXNA4Q9HCM2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLXNA4Q9HCM2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLXNA4Q9HCM2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLXNA4Q9HCM2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLXNA4Q9HCM2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PLXNA4Q9HCM2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PLXNA4Q9HCM2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PLXNA4Q9HCM2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PLXNA4Q9HCM2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PLXNA4Q9HCM2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PLXNA4Q9HCM2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PLXNA4Q9HCM2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PLXNA4Q9HCM2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PLXNA4Q9HCM2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PLXNA4Q9HCM2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PLXNA4Q9HCM2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PLXNA4Q9HCM2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PLXNA4Q9HCM2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PLXNA4Q9HCM2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PLXNA4Q9HCM2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PLXNA4Q9HCM2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PLXNA4Q9HCM2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PLXNA4Q9HCM2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PLXNA4Q9HCM2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PLXNA4Q9HCM2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PLXNA4Q9HCM2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PLXNA4Q9HCM2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PLXNA4Q9HCM2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PLXNA4Q9HCM2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PLXNA4Q9HCM2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PLXNA4Q9HCM2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PLXNA4Q9HCM2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PLXNA4Q9HCM2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PLXNA4Q9HCM2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PLXNA4Q9HCM2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PLXNA4Q9HCM2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PLXNA4Q9HCM2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PLXNA4Q9HCM2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PLXNA4Q9HCM2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PLXNA4Q9HCM2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PLXNA4Q9HCM2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PLXNA4Q9HCM2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PLXNA4Q9HCM2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PLXNA4Q9HCM2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PLXNA4Q9HCM2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PLXNA4Q9HCM2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PLXNA4Q9HCM2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PLXNA4Q9HCM2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PLXNA4Q9HCM2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PLXNA4Q9HCM2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PLXNA4Q9HCM2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PLXNA4Q9HCM2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PLXNA4Q9HCM2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PLXNA4Q9HCM2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PLXNA4Q9HCM2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PLXNA4Q9HCM2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PLXNA4Q9HCM2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PLXNA4Q9HCM2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PLXNA4Q9HCM2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PLXNA4Q9HCM2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PLXNA4Q9HCM2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PLXNA4Q9HCM2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PLXNA4Q9HCM2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PLXNA4Q9HCM2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PLXNA4Q9HCM2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PLXNA4Q9HCM2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PLXNA4Q9HCM2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PLXNA4Q9HCM2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PLXNA4Q9HCM2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PLXNA4Q9HCM2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PLXNA4Q9HCM2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PLXNA4Q9HCM2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PLXNA4Q9HCM2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PLXNA4Q9HCM2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PLXNA4Q9HCM2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PLXNA4Q9HCM2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PLXNA4Q9HCM2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PLXNA4Q9HCM2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLXNA4Q9HCM2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLXNA4Q9HCM2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PLXNA4Q9HCM2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PLXNA4Q9HCM2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PLXNA4Q9HCM2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PLXNA4Q9HCM2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PLXNA4Q9HCM2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLXNA4Q9HCM2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLXNA4Q9HCM2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PLXNA4Q9HCM2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PLXNA4Q9HCM2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PLXNA4Q9HCM2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PLXNA4Q9HCM2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PLXNA4Q9HCM2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PLXNA4Q9HCM2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PLXNA4Q9HCM2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms