Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC58

SLC24A3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A3Q9HC58 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC24A3Q9HC58 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC24A3Q9HC58 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC24A3Q9HC58 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC24A3Q9HC58 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC24A3Q9HC58 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC24A3Q9HC58 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC24A3Q9HC58 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC24A3Q9HC58 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC24A3Q9HC58 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC24A3Q9HC58 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC24A3Q9HC58 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC24A3Q9HC58 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC24A3Q9HC58 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC24A3Q9HC58 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC24A3Q9HC58 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC24A3Q9HC58 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC24A3Q9HC58 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC24A3Q9HC58 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC24A3Q9HC58 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC24A3Q9HC58 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC24A3Q9HC58 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC24A3Q9HC58 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC24A3Q9HC58 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC24A3Q9HC58 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC24A3Q9HC58 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC24A3Q9HC58 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC24A3Q9HC58 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC24A3Q9HC58 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC24A3Q9HC58 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC24A3Q9HC58 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC24A3Q9HC58 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC24A3Q9HC58 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC24A3Q9HC58 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC24A3Q9HC58 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC24A3Q9HC58 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC24A3Q9HC58 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC24A3Q9HC58 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC24A3Q9HC58 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC24A3Q9HC58 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC24A3Q9HC58 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC24A3Q9HC58 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC24A3Q9HC58 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC24A3Q9HC58 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC24A3Q9HC58 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC24A3Q9HC58 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC24A3Q9HC58 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC24A3Q9HC58 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC24A3Q9HC58 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC24A3Q9HC58 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC24A3Q9HC58 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC24A3Q9HC58 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC24A3Q9HC58 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC24A3Q9HC58 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC24A3Q9HC58 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC24A3Q9HC58 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC24A3Q9HC58 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC24A3Q9HC58 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC24A3Q9HC58 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC24A3Q9HC58 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC24A3Q9HC58 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC24A3Q9HC58 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC24A3Q9HC58 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC24A3Q9HC58 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC24A3Q9HC58 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC24A3Q9HC58 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC24A3Q9HC58 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC24A3Q9HC58 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC24A3Q9HC58 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC24A3Q9HC58 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC24A3Q9HC58 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC24A3Q9HC58 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC24A3Q9HC58 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC24A3Q9HC58 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC24A3Q9HC58 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC24A3Q9HC58 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC24A3Q9HC58 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC24A3Q9HC58 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC24A3Q9HC58 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC24A3Q9HC58 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC24A3Q9HC58 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC24A3Q9HC58 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC24A3Q9HC58 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC24A3Q9HC58 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC24A3Q9HC58 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC24A3Q9HC58 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC24A3Q9HC58 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC24A3Q9HC58 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC24A3Q9HC58 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC24A3Q9HC58 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC24A3Q9HC58 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC24A3Q9HC58 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC24A3Q9HC58 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC24A3Q9HC58 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC24A3Q9HC58 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC24A3Q9HC58 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC24A3Q9HC58 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC24A3Q9HC58 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC24A3Q9HC58 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC24A3Q9HC58 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.4 ms