Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBI1

PARVB, Beta-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVBQ9HBI1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PARVBQ9HBI1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PARVBQ9HBI1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PARVBQ9HBI1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PARVBQ9HBI1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PARVBQ9HBI1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PARVBQ9HBI1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PARVBQ9HBI1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PARVBQ9HBI1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PARVBQ9HBI1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PARVBQ9HBI1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PARVBQ9HBI1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PARVBQ9HBI1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PARVBQ9HBI1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PARVBQ9HBI1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PARVBQ9HBI1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PARVBQ9HBI1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PARVBQ9HBI1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PARVBQ9HBI1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PARVBQ9HBI1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PARVBQ9HBI1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PARVBQ9HBI1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PARVBQ9HBI1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PARVBQ9HBI1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PARVBQ9HBI1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PARVBQ9HBI1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PARVBQ9HBI1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PARVBQ9HBI1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PARVBQ9HBI1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PARVBQ9HBI1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PARVBQ9HBI1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PARVBQ9HBI1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PARVBQ9HBI1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PARVBQ9HBI1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PARVBQ9HBI1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PARVBQ9HBI1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PARVBQ9HBI1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PARVBQ9HBI1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PARVBQ9HBI1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PARVBQ9HBI1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PARVBQ9HBI1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PARVBQ9HBI1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PARVBQ9HBI1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PARVBQ9HBI1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PARVBQ9HBI1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PARVBQ9HBI1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PARVBQ9HBI1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PARVBQ9HBI1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PARVBQ9HBI1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PARVBQ9HBI1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PARVBQ9HBI1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PARVBQ9HBI1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PARVBQ9HBI1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PARVBQ9HBI1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PARVBQ9HBI1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PARVBQ9HBI1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PARVBQ9HBI1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PARVBQ9HBI1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PARVBQ9HBI1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PARVBQ9HBI1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PARVBQ9HBI1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PARVBQ9HBI1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PARVBQ9HBI1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PARVBQ9HBI1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PARVBQ9HBI1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PARVBQ9HBI1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PARVBQ9HBI1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PARVBQ9HBI1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARVBQ9HBI1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PARVBQ9HBI1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARVBQ9HBI1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARVBQ9HBI1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARVBQ9HBI1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARVBQ9HBI1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARVBQ9HBI1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARVBQ9HBI1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARVBQ9HBI1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARVBQ9HBI1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARVBQ9HBI1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARVBQ9HBI1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARVBQ9HBI1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARVBQ9HBI1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARVBQ9HBI1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PARVBQ9HBI1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARVBQ9HBI1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARVBQ9HBI1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PARVBQ9HBI1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PARVBQ9HBI1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PARVBQ9HBI1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PARVBQ9HBI1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PARVBQ9HBI1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PARVBQ9HBI1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PARVBQ9HBI1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PARVBQ9HBI1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PARVBQ9HBI1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PARVBQ9HBI1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PARVBQ9HBI1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PARVBQ9HBI1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PARVBQ9HBI1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PARVBQ9HBI1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms