Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4E5

RHOJ, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOJQ9H4E5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RHOJQ9H4E5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RHOJQ9H4E5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RHOJQ9H4E5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RHOJQ9H4E5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RHOJQ9H4E5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RHOJQ9H4E5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHOJQ9H4E5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RHOJQ9H4E5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHOJQ9H4E5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHOJQ9H4E5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHOJQ9H4E5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHOJQ9H4E5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHOJQ9H4E5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHOJQ9H4E5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHOJQ9H4E5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHOJQ9H4E5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHOJQ9H4E5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHOJQ9H4E5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHOJQ9H4E5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHOJQ9H4E5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHOJQ9H4E5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHOJQ9H4E5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHOJQ9H4E5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHOJQ9H4E5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHOJQ9H4E5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOJQ9H4E5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOJQ9H4E5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOJQ9H4E5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOJQ9H4E5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOJQ9H4E5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOJQ9H4E5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOJQ9H4E5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOJQ9H4E5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHOJQ9H4E5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHOJQ9H4E5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHOJQ9H4E5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHOJQ9H4E5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHOJQ9H4E5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOJQ9H4E5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOJQ9H4E5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOJQ9H4E5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOJQ9H4E5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOJQ9H4E5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOJQ9H4E5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOJQ9H4E5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOJQ9H4E5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOJQ9H4E5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOJQ9H4E5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOJQ9H4E5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOJQ9H4E5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOJQ9H4E5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOJQ9H4E5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOJQ9H4E5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOJQ9H4E5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOJQ9H4E5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOJQ9H4E5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOJQ9H4E5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOJQ9H4E5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOJQ9H4E5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOJQ9H4E5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOJQ9H4E5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOJQ9H4E5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOJQ9H4E5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOJQ9H4E5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOJQ9H4E5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOJQ9H4E5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOJQ9H4E5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOJQ9H4E5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOJQ9H4E5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOJQ9H4E5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOJQ9H4E5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOJQ9H4E5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOJQ9H4E5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOJQ9H4E5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOJQ9H4E5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHOJQ9H4E5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHOJQ9H4E5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHOJQ9H4E5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHOJQ9H4E5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHOJQ9H4E5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHOJQ9H4E5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHOJQ9H4E5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHOJQ9H4E5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHOJQ9H4E5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHOJQ9H4E5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHOJQ9H4E5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHOJQ9H4E5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHOJQ9H4E5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHOJQ9H4E5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHOJQ9H4E5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHOJQ9H4E5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RHOJQ9H4E5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHOJQ9H4E5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RHOJQ9H4E5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RHOJQ9H4E5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHOJQ9H4E5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHOJQ9H4E5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHOJQ9H4E5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHOJQ9H4E5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms