Protein–RNA interactions for Protein: Q9H320

VCX, Variable charge X-linked protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCXQ9H320 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VCXQ9H320 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VCXQ9H320 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VCXQ9H320 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCXQ9H320 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCXQ9H320 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
VCXQ9H320 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCXQ9H320 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCXQ9H320 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VCXQ9H320 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VCXQ9H320 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VCXQ9H320 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VCXQ9H320 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VCXQ9H320 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VCXQ9H320 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VCXQ9H320 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
VCXQ9H320 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VCXQ9H320 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VCXQ9H320 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
VCXQ9H320 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VCXQ9H320 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VCXQ9H320 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VCXQ9H320 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
VCXQ9H320 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
VCXQ9H320 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VCXQ9H320 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
VCXQ9H320 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VCXQ9H320 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VCXQ9H320 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VCXQ9H320 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VCXQ9H320 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
VCXQ9H320 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
VCXQ9H320 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
VCXQ9H320 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VCXQ9H320 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VCXQ9H320 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VCXQ9H320 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VCXQ9H320 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VCXQ9H320 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VCXQ9H320 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VCXQ9H320 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VCXQ9H320 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VCXQ9H320 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VCXQ9H320 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VCXQ9H320 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VCXQ9H320 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VCXQ9H320 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VCXQ9H320 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VCXQ9H320 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
VCXQ9H320 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VCXQ9H320 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VCXQ9H320 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCXQ9H320 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCXQ9H320 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCXQ9H320 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCXQ9H320 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCXQ9H320 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCXQ9H320 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCXQ9H320 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCXQ9H320 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCXQ9H320 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCXQ9H320 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCXQ9H320 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
VCXQ9H320 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VCXQ9H320 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VCXQ9H320 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VCXQ9H320 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VCXQ9H320 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VCXQ9H320 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VCXQ9H320 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VCXQ9H320 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VCXQ9H320 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VCXQ9H320 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VCXQ9H320 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VCXQ9H320 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VCXQ9H320 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VCXQ9H320 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VCXQ9H320 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VCXQ9H320 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VCXQ9H320 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VCXQ9H320 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VCXQ9H320 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VCXQ9H320 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VCXQ9H320 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VCXQ9H320 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VCXQ9H320 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VCXQ9H320 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VCXQ9H320 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VCXQ9H320 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VCXQ9H320 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VCXQ9H320 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VCXQ9H320 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
VCXQ9H320 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VCXQ9H320 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VCXQ9H320 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VCXQ9H320 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
VCXQ9H320 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VCXQ9H320 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VCXQ9H320 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VCXQ9H320 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms