Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LINC00597Q9H2U6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LINC00597Q9H2U6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LINC00597Q9H2U6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LINC00597Q9H2U6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LINC00597Q9H2U6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LINC00597Q9H2U6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LINC00597Q9H2U6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LINC00597Q9H2U6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LINC00597Q9H2U6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LINC00597Q9H2U6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LINC00597Q9H2U6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LINC00597Q9H2U6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LINC00597Q9H2U6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LINC00597Q9H2U6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LINC00597Q9H2U6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LINC00597Q9H2U6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LINC00597Q9H2U6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LINC00597Q9H2U6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LINC00597Q9H2U6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LINC00597Q9H2U6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
LINC00597Q9H2U6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LINC00597Q9H2U6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LINC00597Q9H2U6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LINC00597Q9H2U6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LINC00597Q9H2U6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
LINC00597Q9H2U6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LINC00597Q9H2U6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LINC00597Q9H2U6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LINC00597Q9H2U6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LINC00597Q9H2U6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LINC00597Q9H2U6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LINC00597Q9H2U6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LINC00597Q9H2U6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LINC00597Q9H2U6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LINC00597Q9H2U6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LINC00597Q9H2U6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LINC00597Q9H2U6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LINC00597Q9H2U6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LINC00597Q9H2U6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LINC00597Q9H2U6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LINC00597Q9H2U6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LINC00597Q9H2U6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LINC00597Q9H2U6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LINC00597Q9H2U6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LINC00597Q9H2U6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LINC00597Q9H2U6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
LINC00597Q9H2U6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LINC00597Q9H2U6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LINC00597Q9H2U6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LINC00597Q9H2U6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LINC00597Q9H2U6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LINC00597Q9H2U6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LINC00597Q9H2U6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LINC00597Q9H2U6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LINC00597Q9H2U6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LINC00597Q9H2U6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LINC00597Q9H2U6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LINC00597Q9H2U6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LINC00597Q9H2U6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LINC00597Q9H2U6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LINC00597Q9H2U6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LINC00597Q9H2U6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LINC00597Q9H2U6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LINC00597Q9H2U6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LINC00597Q9H2U6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LINC00597Q9H2U6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LINC00597Q9H2U6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LINC00597Q9H2U6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LINC00597Q9H2U6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LINC00597Q9H2U6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LINC00597Q9H2U6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LINC00597Q9H2U6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LINC00597Q9H2U6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LINC00597Q9H2U6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LINC00597Q9H2U6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LINC00597Q9H2U6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LINC00597Q9H2U6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LINC00597Q9H2U6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LINC00597Q9H2U6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LINC00597Q9H2U6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LINC00597Q9H2U6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LINC00597Q9H2U6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LINC00597Q9H2U6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LINC00597Q9H2U6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LINC00597Q9H2U6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LINC00597Q9H2U6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LINC00597Q9H2U6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LINC00597Q9H2U6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LINC00597Q9H2U6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LINC00597Q9H2U6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LINC00597Q9H2U6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LINC00597Q9H2U6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LINC00597Q9H2U6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LINC00597Q9H2U6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LINC00597Q9H2U6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LINC00597Q9H2U6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LINC00597Q9H2U6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LINC00597Q9H2U6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LINC00597Q9H2U6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms