Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LHX5Q9H2C1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LHX5Q9H2C1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LHX5Q9H2C1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LHX5Q9H2C1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LHX5Q9H2C1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LHX5Q9H2C1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LHX5Q9H2C1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LHX5Q9H2C1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LHX5Q9H2C1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LHX5Q9H2C1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LHX5Q9H2C1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LHX5Q9H2C1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LHX5Q9H2C1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LHX5Q9H2C1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LHX5Q9H2C1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LHX5Q9H2C1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LHX5Q9H2C1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LHX5Q9H2C1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
LHX5Q9H2C1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LHX5Q9H2C1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LHX5Q9H2C1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LHX5Q9H2C1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LHX5Q9H2C1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LHX5Q9H2C1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LHX5Q9H2C1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LHX5Q9H2C1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LHX5Q9H2C1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LHX5Q9H2C1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LHX5Q9H2C1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LHX5Q9H2C1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LHX5Q9H2C1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LHX5Q9H2C1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LHX5Q9H2C1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LHX5Q9H2C1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LHX5Q9H2C1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
LHX5Q9H2C1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LHX5Q9H2C1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LHX5Q9H2C1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LHX5Q9H2C1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LHX5Q9H2C1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LHX5Q9H2C1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LHX5Q9H2C1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
LHX5Q9H2C1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LHX5Q9H2C1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LHX5Q9H2C1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LHX5Q9H2C1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
LHX5Q9H2C1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LHX5Q9H2C1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LHX5Q9H2C1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LHX5Q9H2C1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LHX5Q9H2C1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
LHX5Q9H2C1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LHX5Q9H2C1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LHX5Q9H2C1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
LHX5Q9H2C1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LHX5Q9H2C1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LHX5Q9H2C1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LHX5Q9H2C1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LHX5Q9H2C1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LHX5Q9H2C1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LHX5Q9H2C1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LHX5Q9H2C1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LHX5Q9H2C1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LHX5Q9H2C1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LHX5Q9H2C1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LHX5Q9H2C1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LHX5Q9H2C1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LHX5Q9H2C1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LHX5Q9H2C1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LHX5Q9H2C1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LHX5Q9H2C1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LHX5Q9H2C1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LHX5Q9H2C1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LHX5Q9H2C1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LHX5Q9H2C1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LHX5Q9H2C1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LHX5Q9H2C1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LHX5Q9H2C1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LHX5Q9H2C1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LHX5Q9H2C1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LHX5Q9H2C1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LHX5Q9H2C1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LHX5Q9H2C1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LHX5Q9H2C1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LHX5Q9H2C1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LHX5Q9H2C1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LHX5Q9H2C1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LHX5Q9H2C1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LHX5Q9H2C1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LHX5Q9H2C1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
LHX5Q9H2C1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
LHX5Q9H2C1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LHX5Q9H2C1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LHX5Q9H2C1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LHX5Q9H2C1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LHX5Q9H2C1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LHX5Q9H2C1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LHX5Q9H2C1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LHX5Q9H2C1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms