Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
EHD4Q9H223 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
EHD4Q9H223 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
EHD4Q9H223 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
EHD4Q9H223 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
EHD4Q9H223 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
EHD4Q9H223 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
EHD4Q9H223 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
EHD4Q9H223 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
EHD4Q9H223 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
EHD4Q9H223 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
EHD4Q9H223 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
EHD4Q9H223 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
EHD4Q9H223 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
EHD4Q9H223 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
EHD4Q9H223 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
EHD4Q9H223 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
EHD4Q9H223 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
EHD4Q9H223 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
EHD4Q9H223 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
EHD4Q9H223 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
EHD4Q9H223 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
EHD4Q9H223 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
EHD4Q9H223 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
EHD4Q9H223 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
EHD4Q9H223 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
EHD4Q9H223 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
EHD4Q9H223 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
EHD4Q9H223 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
EHD4Q9H223 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
EHD4Q9H223 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
EHD4Q9H223 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
EHD4Q9H223 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
EHD4Q9H223 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
EHD4Q9H223 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
EHD4Q9H223 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
EHD4Q9H223 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
EHD4Q9H223 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
EHD4Q9H223 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
EHD4Q9H223 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
EHD4Q9H223 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
EHD4Q9H223 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
EHD4Q9H223 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
EHD4Q9H223 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
EHD4Q9H223 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
EHD4Q9H223 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
EHD4Q9H223 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
EHD4Q9H223 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
EHD4Q9H223 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
EHD4Q9H223 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
EHD4Q9H223 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
EHD4Q9H223 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
EHD4Q9H223 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
EHD4Q9H223 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
EHD4Q9H223 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
EHD4Q9H223 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
EHD4Q9H223 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
EHD4Q9H223 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EHD4Q9H223 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
EHD4Q9H223 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EHD4Q9H223 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EHD4Q9H223 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EHD4Q9H223 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
EHD4Q9H223 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
EHD4Q9H223 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
EHD4Q9H223 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
EHD4Q9H223 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
EHD4Q9H223 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EHD4Q9H223 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
EHD4Q9H223 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EHD4Q9H223 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EHD4Q9H223 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EHD4Q9H223 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EHD4Q9H223 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
EHD4Q9H223 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EHD4Q9H223 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EHD4Q9H223 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
EHD4Q9H223 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
EHD4Q9H223 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
EHD4Q9H223 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
EHD4Q9H223 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
EHD4Q9H223 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
EHD4Q9H223 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
EHD4Q9H223 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
EHD4Q9H223 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
EHD4Q9H223 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
EHD4Q9H223 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
EHD4Q9H223 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
EHD4Q9H223 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
EHD4Q9H223 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
EHD4Q9H223 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
EHD4Q9H223 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
EHD4Q9H223 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
EHD4Q9H223 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
EHD4Q9H223 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
EHD4Q9H223 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
EHD4Q9H223 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
EHD4Q9H223 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
EHD4Q9H223 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
EHD4Q9H223 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms