Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC90BQ9GZT6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC90BQ9GZT6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC90BQ9GZT6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC90BQ9GZT6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC90BQ9GZT6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC90BQ9GZT6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC90BQ9GZT6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC90BQ9GZT6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC90BQ9GZT6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC90BQ9GZT6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC90BQ9GZT6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC90BQ9GZT6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC90BQ9GZT6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC90BQ9GZT6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC90BQ9GZT6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC90BQ9GZT6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC90BQ9GZT6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC90BQ9GZT6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC90BQ9GZT6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC90BQ9GZT6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC90BQ9GZT6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC90BQ9GZT6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC90BQ9GZT6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC90BQ9GZT6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC90BQ9GZT6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC90BQ9GZT6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC90BQ9GZT6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC90BQ9GZT6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC90BQ9GZT6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC90BQ9GZT6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC90BQ9GZT6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC90BQ9GZT6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC90BQ9GZT6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC90BQ9GZT6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC90BQ9GZT6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC90BQ9GZT6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC90BQ9GZT6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC90BQ9GZT6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC90BQ9GZT6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC90BQ9GZT6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC90BQ9GZT6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC90BQ9GZT6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC90BQ9GZT6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC90BQ9GZT6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC90BQ9GZT6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC90BQ9GZT6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC90BQ9GZT6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC90BQ9GZT6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC90BQ9GZT6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC90BQ9GZT6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC90BQ9GZT6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC90BQ9GZT6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC90BQ9GZT6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC90BQ9GZT6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC90BQ9GZT6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC90BQ9GZT6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC90BQ9GZT6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC90BQ9GZT6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC90BQ9GZT6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC90BQ9GZT6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC90BQ9GZT6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC90BQ9GZT6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC90BQ9GZT6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC90BQ9GZT6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC90BQ9GZT6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC90BQ9GZT6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC90BQ9GZT6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC90BQ9GZT6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC90BQ9GZT6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC90BQ9GZT6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC90BQ9GZT6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC90BQ9GZT6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC90BQ9GZT6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC90BQ9GZT6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC90BQ9GZT6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC90BQ9GZT6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC90BQ9GZT6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC90BQ9GZT6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC90BQ9GZT6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC90BQ9GZT6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC90BQ9GZT6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC90BQ9GZT6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC90BQ9GZT6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC90BQ9GZT6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC90BQ9GZT6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC90BQ9GZT6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC90BQ9GZT6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC90BQ9GZT6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC90BQ9GZT6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC90BQ9GZT6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC90BQ9GZT6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC90BQ9GZT6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC90BQ9GZT6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC90BQ9GZT6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC90BQ9GZT6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC90BQ9GZT6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC90BQ9GZT6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC90BQ9GZT6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC90BQ9GZT6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms