Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM8Q9BZR9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM8Q9BZR9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM8Q9BZR9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM8Q9BZR9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM8Q9BZR9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM8Q9BZR9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM8Q9BZR9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM8Q9BZR9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM8Q9BZR9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM8Q9BZR9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM8Q9BZR9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM8Q9BZR9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM8Q9BZR9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM8Q9BZR9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM8Q9BZR9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM8Q9BZR9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM8Q9BZR9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM8Q9BZR9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM8Q9BZR9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM8Q9BZR9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM8Q9BZR9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM8Q9BZR9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM8Q9BZR9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM8Q9BZR9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM8Q9BZR9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM8Q9BZR9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM8Q9BZR9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM8Q9BZR9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM8Q9BZR9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM8Q9BZR9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM8Q9BZR9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM8Q9BZR9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM8Q9BZR9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM8Q9BZR9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM8Q9BZR9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM8Q9BZR9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM8Q9BZR9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM8Q9BZR9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM8Q9BZR9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM8Q9BZR9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM8Q9BZR9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM8Q9BZR9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM8Q9BZR9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM8Q9BZR9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM8Q9BZR9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM8Q9BZR9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM8Q9BZR9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM8Q9BZR9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM8Q9BZR9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM8Q9BZR9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM8Q9BZR9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM8Q9BZR9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM8Q9BZR9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM8Q9BZR9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM8Q9BZR9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM8Q9BZR9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM8Q9BZR9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM8Q9BZR9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM8Q9BZR9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM8Q9BZR9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM8Q9BZR9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM8Q9BZR9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM8Q9BZR9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM8Q9BZR9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM8Q9BZR9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM8Q9BZR9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM8Q9BZR9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM8Q9BZR9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM8Q9BZR9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIM8Q9BZR9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM8Q9BZR9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM8Q9BZR9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM8Q9BZR9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM8Q9BZR9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM8Q9BZR9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM8Q9BZR9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM8Q9BZR9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM8Q9BZR9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM8Q9BZR9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM8Q9BZR9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM8Q9BZR9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM8Q9BZR9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM8Q9BZR9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM8Q9BZR9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM8Q9BZR9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM8Q9BZR9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM8Q9BZR9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM8Q9BZR9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM8Q9BZR9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM8Q9BZR9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM8Q9BZR9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM8Q9BZR9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM8Q9BZR9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM8Q9BZR9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM8Q9BZR9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM8Q9BZR9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM8Q9BZR9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM8Q9BZR9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM8Q9BZR9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms