Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZB8

CPEB1, Cytoplasmic polyadenylation element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB1Q9BZB8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CPEB1Q9BZB8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CPEB1Q9BZB8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CPEB1Q9BZB8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CPEB1Q9BZB8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CPEB1Q9BZB8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CPEB1Q9BZB8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CPEB1Q9BZB8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CPEB1Q9BZB8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CPEB1Q9BZB8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CPEB1Q9BZB8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CPEB1Q9BZB8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CPEB1Q9BZB8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CPEB1Q9BZB8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CPEB1Q9BZB8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CPEB1Q9BZB8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CPEB1Q9BZB8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CPEB1Q9BZB8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CPEB1Q9BZB8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CPEB1Q9BZB8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CPEB1Q9BZB8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CPEB1Q9BZB8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CPEB1Q9BZB8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CPEB1Q9BZB8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CPEB1Q9BZB8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CPEB1Q9BZB8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CPEB1Q9BZB8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CPEB1Q9BZB8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CPEB1Q9BZB8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CPEB1Q9BZB8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CPEB1Q9BZB8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CPEB1Q9BZB8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CPEB1Q9BZB8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CPEB1Q9BZB8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CPEB1Q9BZB8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CPEB1Q9BZB8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CPEB1Q9BZB8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CPEB1Q9BZB8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CPEB1Q9BZB8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CPEB1Q9BZB8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CPEB1Q9BZB8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CPEB1Q9BZB8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CPEB1Q9BZB8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CPEB1Q9BZB8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CPEB1Q9BZB8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CPEB1Q9BZB8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CPEB1Q9BZB8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPEB1Q9BZB8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPEB1Q9BZB8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CPEB1Q9BZB8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CPEB1Q9BZB8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CPEB1Q9BZB8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CPEB1Q9BZB8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CPEB1Q9BZB8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CPEB1Q9BZB8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CPEB1Q9BZB8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CPEB1Q9BZB8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CPEB1Q9BZB8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CPEB1Q9BZB8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CPEB1Q9BZB8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CPEB1Q9BZB8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CPEB1Q9BZB8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CPEB1Q9BZB8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CPEB1Q9BZB8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CPEB1Q9BZB8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CPEB1Q9BZB8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CPEB1Q9BZB8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPEB1Q9BZB8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPEB1Q9BZB8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CPEB1Q9BZB8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CPEB1Q9BZB8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CPEB1Q9BZB8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CPEB1Q9BZB8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CPEB1Q9BZB8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CPEB1Q9BZB8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CPEB1Q9BZB8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CPEB1Q9BZB8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CPEB1Q9BZB8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CPEB1Q9BZB8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CPEB1Q9BZB8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CPEB1Q9BZB8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CPEB1Q9BZB8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CPEB1Q9BZB8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CPEB1Q9BZB8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CPEB1Q9BZB8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CPEB1Q9BZB8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CPEB1Q9BZB8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CPEB1Q9BZB8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CPEB1Q9BZB8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CPEB1Q9BZB8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CPEB1Q9BZB8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CPEB1Q9BZB8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CPEB1Q9BZB8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CPEB1Q9BZB8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CPEB1Q9BZB8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CPEB1Q9BZB8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CPEB1Q9BZB8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CPEB1Q9BZB8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CPEB1Q9BZB8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPEB1Q9BZB8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms