Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX4

IFIH1, Interferon-induced helicase C domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,025 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIH1Q9BYX4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
IFIH1Q9BYX4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFIH1Q9BYX4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFIH1Q9BYX4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
IFIH1Q9BYX4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
IFIH1Q9BYX4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IFIH1Q9BYX4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IFIH1Q9BYX4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IFIH1Q9BYX4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IFIH1Q9BYX4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
IFIH1Q9BYX4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
IFIH1Q9BYX4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
IFIH1Q9BYX4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IFIH1Q9BYX4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
IFIH1Q9BYX4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
IFIH1Q9BYX4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
IFIH1Q9BYX4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
IFIH1Q9BYX4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
IFIH1Q9BYX4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
IFIH1Q9BYX4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
IFIH1Q9BYX4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
IFIH1Q9BYX4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
IFIH1Q9BYX4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
IFIH1Q9BYX4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
IFIH1Q9BYX4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
IFIH1Q9BYX4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
IFIH1Q9BYX4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFIH1Q9BYX4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFIH1Q9BYX4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
IFIH1Q9BYX4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
IFIH1Q9BYX4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFIH1Q9BYX4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFIH1Q9BYX4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IFIH1Q9BYX4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IFIH1Q9BYX4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
IFIH1Q9BYX4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
IFIH1Q9BYX4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
IFIH1Q9BYX4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IFIH1Q9BYX4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
IFIH1Q9BYX4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFIH1Q9BYX4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFIH1Q9BYX4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFIH1Q9BYX4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFIH1Q9BYX4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFIH1Q9BYX4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFIH1Q9BYX4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFIH1Q9BYX4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFIH1Q9BYX4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFIH1Q9BYX4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFIH1Q9BYX4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFIH1Q9BYX4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFIH1Q9BYX4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFIH1Q9BYX4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
IFIH1Q9BYX4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFIH1Q9BYX4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFIH1Q9BYX4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFIH1Q9BYX4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFIH1Q9BYX4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFIH1Q9BYX4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFIH1Q9BYX4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
IFIH1Q9BYX4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IFIH1Q9BYX4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
IFIH1Q9BYX4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
IFIH1Q9BYX4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IFIH1Q9BYX4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
IFIH1Q9BYX4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IFIH1Q9BYX4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
IFIH1Q9BYX4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.57■■■□□ 2
IFIH1Q9BYX4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
IFIH1Q9BYX4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
IFIH1Q9BYX4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
IFIH1Q9BYX4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IFIH1Q9BYX4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IFIH1Q9BYX4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IFIH1Q9BYX4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IFIH1Q9BYX4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
IFIH1Q9BYX4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IFIH1Q9BYX4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
IFIH1Q9BYX4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
IFIH1Q9BYX4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IFIH1Q9BYX4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IFIH1Q9BYX4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
IFIH1Q9BYX4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
IFIH1Q9BYX4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IFIH1Q9BYX4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
IFIH1Q9BYX4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IFIH1Q9BYX4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IFIH1Q9BYX4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
IFIH1Q9BYX4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
IFIH1Q9BYX4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IFIH1Q9BYX4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
IFIH1Q9BYX4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
IFIH1Q9BYX4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
IFIH1Q9BYX4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
IFIH1Q9BYX4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IFIH1Q9BYX4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IFIH1Q9BYX4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IFIH1Q9BYX4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IFIH1Q9BYX4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IFIH1Q9BYX4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms