Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM54Q9BYV2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM54Q9BYV2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM54Q9BYV2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM54Q9BYV2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM54Q9BYV2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM54Q9BYV2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM54Q9BYV2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM54Q9BYV2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM54Q9BYV2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM54Q9BYV2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM54Q9BYV2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM54Q9BYV2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM54Q9BYV2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM54Q9BYV2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM54Q9BYV2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM54Q9BYV2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM54Q9BYV2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM54Q9BYV2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM54Q9BYV2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM54Q9BYV2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM54Q9BYV2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM54Q9BYV2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM54Q9BYV2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM54Q9BYV2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM54Q9BYV2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM54Q9BYV2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM54Q9BYV2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM54Q9BYV2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM54Q9BYV2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM54Q9BYV2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM54Q9BYV2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM54Q9BYV2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM54Q9BYV2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM54Q9BYV2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM54Q9BYV2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM54Q9BYV2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM54Q9BYV2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM54Q9BYV2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM54Q9BYV2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM54Q9BYV2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM54Q9BYV2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM54Q9BYV2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM54Q9BYV2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM54Q9BYV2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM54Q9BYV2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM54Q9BYV2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM54Q9BYV2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRIM54Q9BYV2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRIM54Q9BYV2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRIM54Q9BYV2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM54Q9BYV2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM54Q9BYV2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM54Q9BYV2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM54Q9BYV2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM54Q9BYV2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM54Q9BYV2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM54Q9BYV2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM54Q9BYV2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM54Q9BYV2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM54Q9BYV2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM54Q9BYV2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM54Q9BYV2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM54Q9BYV2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM54Q9BYV2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM54Q9BYV2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM54Q9BYV2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM54Q9BYV2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM54Q9BYV2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM54Q9BYV2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM54Q9BYV2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM54Q9BYV2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM54Q9BYV2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM54Q9BYV2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM54Q9BYV2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM54Q9BYV2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM54Q9BYV2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM54Q9BYV2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM54Q9BYV2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM54Q9BYV2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM54Q9BYV2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM54Q9BYV2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM54Q9BYV2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM54Q9BYV2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM54Q9BYV2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM54Q9BYV2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM54Q9BYV2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM54Q9BYV2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM54Q9BYV2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM54Q9BYV2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM54Q9BYV2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM54Q9BYV2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM54Q9BYV2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM54Q9BYV2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM54Q9BYV2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM54Q9BYV2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM54Q9BYV2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM54Q9BYV2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM54Q9BYV2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM54Q9BYV2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms