Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT27Q9BW83 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT27Q9BW83 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT27Q9BW83 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT27Q9BW83 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT27Q9BW83 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT27Q9BW83 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT27Q9BW83 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT27Q9BW83 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT27Q9BW83 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT27Q9BW83 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT27Q9BW83 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT27Q9BW83 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT27Q9BW83 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT27Q9BW83 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT27Q9BW83 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT27Q9BW83 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT27Q9BW83 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT27Q9BW83 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT27Q9BW83 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT27Q9BW83 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT27Q9BW83 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT27Q9BW83 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
IFT27Q9BW83 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
IFT27Q9BW83 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
IFT27Q9BW83 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT27Q9BW83 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT27Q9BW83 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT27Q9BW83 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT27Q9BW83 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT27Q9BW83 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT27Q9BW83 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT27Q9BW83 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT27Q9BW83 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT27Q9BW83 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT27Q9BW83 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT27Q9BW83 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT27Q9BW83 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT27Q9BW83 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT27Q9BW83 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT27Q9BW83 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT27Q9BW83 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT27Q9BW83 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT27Q9BW83 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT27Q9BW83 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT27Q9BW83 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT27Q9BW83 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT27Q9BW83 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT27Q9BW83 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT27Q9BW83 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT27Q9BW83 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT27Q9BW83 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT27Q9BW83 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT27Q9BW83 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT27Q9BW83 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT27Q9BW83 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT27Q9BW83 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT27Q9BW83 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT27Q9BW83 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT27Q9BW83 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT27Q9BW83 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
IFT27Q9BW83 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
IFT27Q9BW83 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT27Q9BW83 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT27Q9BW83 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT27Q9BW83 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT27Q9BW83 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT27Q9BW83 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT27Q9BW83 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT27Q9BW83 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT27Q9BW83 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT27Q9BW83 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT27Q9BW83 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT27Q9BW83 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT27Q9BW83 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT27Q9BW83 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT27Q9BW83 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT27Q9BW83 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT27Q9BW83 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT27Q9BW83 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT27Q9BW83 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT27Q9BW83 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT27Q9BW83 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT27Q9BW83 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT27Q9BW83 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT27Q9BW83 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT27Q9BW83 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT27Q9BW83 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT27Q9BW83 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT27Q9BW83 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT27Q9BW83 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT27Q9BW83 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT27Q9BW83 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFT27Q9BW83 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFT27Q9BW83 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFT27Q9BW83 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT27Q9BW83 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT27Q9BW83 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT27Q9BW83 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT27Q9BW83 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
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