Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
HIRIP3Q9BW71 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
HIRIP3Q9BW71 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
HIRIP3Q9BW71 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
HIRIP3Q9BW71 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
HIRIP3Q9BW71 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
HIRIP3Q9BW71 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
HIRIP3Q9BW71 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
HIRIP3Q9BW71 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
HIRIP3Q9BW71 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
HIRIP3Q9BW71 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
HIRIP3Q9BW71 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
HIRIP3Q9BW71 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
HIRIP3Q9BW71 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
HIRIP3Q9BW71 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
HIRIP3Q9BW71 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
HIRIP3Q9BW71 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC35.58■■■■□ 3.29
HIRIP3Q9BW71 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
HIRIP3Q9BW71 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
HIRIP3Q9BW71 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
HIRIP3Q9BW71 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
HIRIP3Q9BW71 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
HIRIP3Q9BW71 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
HIRIP3Q9BW71 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
HIRIP3Q9BW71 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC35.56■■■■□ 3.28
HIRIP3Q9BW71 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
HIRIP3Q9BW71 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
HIRIP3Q9BW71 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
HIRIP3Q9BW71 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
HIRIP3Q9BW71 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
HIRIP3Q9BW71 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
HIRIP3Q9BW71 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
HIRIP3Q9BW71 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
HIRIP3Q9BW71 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
HIRIP3Q9BW71 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
HIRIP3Q9BW71 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC35.53■■■■□ 3.28
HIRIP3Q9BW71 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
HIRIP3Q9BW71 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
HIRIP3Q9BW71 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
HIRIP3Q9BW71 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
HIRIP3Q9BW71 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
HIRIP3Q9BW71 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC35.51■■■■□ 3.28
HIRIP3Q9BW71 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
HIRIP3Q9BW71 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
HIRIP3Q9BW71 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
HIRIP3Q9BW71 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
HIRIP3Q9BW71 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
HIRIP3Q9BW71 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
HIRIP3Q9BW71 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
HIRIP3Q9BW71 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
HIRIP3Q9BW71 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
HIRIP3Q9BW71 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
HIRIP3Q9BW71 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
HIRIP3Q9BW71 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
HIRIP3Q9BW71 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC35.48■■■■□ 3.27
HIRIP3Q9BW71 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
HIRIP3Q9BW71 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
HIRIP3Q9BW71 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
HIRIP3Q9BW71 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
HIRIP3Q9BW71 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
HIRIP3Q9BW71 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
HIRIP3Q9BW71 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
HIRIP3Q9BW71 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
HIRIP3Q9BW71 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
HIRIP3Q9BW71 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
HIRIP3Q9BW71 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
HIRIP3Q9BW71 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
HIRIP3Q9BW71 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
HIRIP3Q9BW71 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
HIRIP3Q9BW71 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
HIRIP3Q9BW71 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
HIRIP3Q9BW71 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
HIRIP3Q9BW71 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
HIRIP3Q9BW71 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
HIRIP3Q9BW71 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
HIRIP3Q9BW71 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
HIRIP3Q9BW71 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
HIRIP3Q9BW71 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
HIRIP3Q9BW71 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
HIRIP3Q9BW71 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
HIRIP3Q9BW71 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
HIRIP3Q9BW71 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
HIRIP3Q9BW71 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
HIRIP3Q9BW71 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
HIRIP3Q9BW71 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
HIRIP3Q9BW71 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
HIRIP3Q9BW71 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
HIRIP3Q9BW71 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
HIRIP3Q9BW71 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
HIRIP3Q9BW71 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
HIRIP3Q9BW71 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
HIRIP3Q9BW71 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
HIRIP3Q9BW71 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
HIRIP3Q9BW71 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
HIRIP3Q9BW71 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
HIRIP3Q9BW71 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
HIRIP3Q9BW71 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
HIRIP3Q9BW71 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
HIRIP3Q9BW71 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
HIRIP3Q9BW71 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms