Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIOK2Q9BVS4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIOK2Q9BVS4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIOK2Q9BVS4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RIOK2Q9BVS4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIOK2Q9BVS4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIOK2Q9BVS4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIOK2Q9BVS4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIOK2Q9BVS4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIOK2Q9BVS4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIOK2Q9BVS4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RIOK2Q9BVS4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIOK2Q9BVS4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIOK2Q9BVS4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RIOK2Q9BVS4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIOK2Q9BVS4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIOK2Q9BVS4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIOK2Q9BVS4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIOK2Q9BVS4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIOK2Q9BVS4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RIOK2Q9BVS4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIOK2Q9BVS4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIOK2Q9BVS4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RIOK2Q9BVS4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIOK2Q9BVS4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIOK2Q9BVS4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIOK2Q9BVS4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIOK2Q9BVS4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIOK2Q9BVS4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIOK2Q9BVS4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIOK2Q9BVS4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIOK2Q9BVS4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIOK2Q9BVS4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIOK2Q9BVS4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIOK2Q9BVS4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIOK2Q9BVS4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIOK2Q9BVS4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIOK2Q9BVS4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIOK2Q9BVS4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIOK2Q9BVS4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIOK2Q9BVS4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIOK2Q9BVS4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIOK2Q9BVS4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIOK2Q9BVS4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIOK2Q9BVS4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIOK2Q9BVS4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIOK2Q9BVS4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIOK2Q9BVS4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIOK2Q9BVS4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIOK2Q9BVS4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIOK2Q9BVS4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIOK2Q9BVS4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIOK2Q9BVS4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIOK2Q9BVS4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIOK2Q9BVS4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIOK2Q9BVS4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIOK2Q9BVS4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIOK2Q9BVS4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIOK2Q9BVS4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIOK2Q9BVS4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIOK2Q9BVS4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIOK2Q9BVS4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIOK2Q9BVS4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RIOK2Q9BVS4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIOK2Q9BVS4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIOK2Q9BVS4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RIOK2Q9BVS4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIOK2Q9BVS4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIOK2Q9BVS4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIOK2Q9BVS4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIOK2Q9BVS4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIOK2Q9BVS4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIOK2Q9BVS4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIOK2Q9BVS4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIOK2Q9BVS4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIOK2Q9BVS4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIOK2Q9BVS4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RIOK2Q9BVS4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIOK2Q9BVS4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIOK2Q9BVS4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIOK2Q9BVS4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIOK2Q9BVS4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIOK2Q9BVS4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIOK2Q9BVS4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIOK2Q9BVS4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIOK2Q9BVS4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIOK2Q9BVS4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RIOK2Q9BVS4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIOK2Q9BVS4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIOK2Q9BVS4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIOK2Q9BVS4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIOK2Q9BVS4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIOK2Q9BVS4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIOK2Q9BVS4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIOK2Q9BVS4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIOK2Q9BVS4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIOK2Q9BVS4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIOK2Q9BVS4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIOK2Q9BVS4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RIOK2Q9BVS4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms