Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC77Q9BR77 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC77Q9BR77 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC77Q9BR77 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC77Q9BR77 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC77Q9BR77 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC77Q9BR77 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC77Q9BR77 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC77Q9BR77 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC77Q9BR77 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC77Q9BR77 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC77Q9BR77 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC77Q9BR77 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC77Q9BR77 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC77Q9BR77 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC77Q9BR77 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC77Q9BR77 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC77Q9BR77 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC77Q9BR77 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC77Q9BR77 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC77Q9BR77 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC77Q9BR77 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC77Q9BR77 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC77Q9BR77 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC77Q9BR77 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC77Q9BR77 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC77Q9BR77 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC77Q9BR77 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC77Q9BR77 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC77Q9BR77 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC77Q9BR77 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC77Q9BR77 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC77Q9BR77 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC77Q9BR77 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC77Q9BR77 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC77Q9BR77 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC77Q9BR77 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC77Q9BR77 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC77Q9BR77 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC77Q9BR77 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC77Q9BR77 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC77Q9BR77 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC77Q9BR77 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC77Q9BR77 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC77Q9BR77 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC77Q9BR77 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC77Q9BR77 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC77Q9BR77 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC77Q9BR77 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC77Q9BR77 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC77Q9BR77 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC77Q9BR77 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC77Q9BR77 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC77Q9BR77 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC77Q9BR77 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC77Q9BR77 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC77Q9BR77 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC77Q9BR77 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC77Q9BR77 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC77Q9BR77 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC77Q9BR77 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC77Q9BR77 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC77Q9BR77 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC77Q9BR77 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC77Q9BR77 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC77Q9BR77 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC77Q9BR77 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC77Q9BR77 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC77Q9BR77 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC77Q9BR77 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC77Q9BR77 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC77Q9BR77 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC77Q9BR77 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC77Q9BR77 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC77Q9BR77 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC77Q9BR77 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC77Q9BR77 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC77Q9BR77 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC77Q9BR77 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC77Q9BR77 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC77Q9BR77 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC77Q9BR77 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC77Q9BR77 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC77Q9BR77 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC77Q9BR77 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC77Q9BR77 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC77Q9BR77 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC77Q9BR77 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC77Q9BR77 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC77Q9BR77 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC77Q9BR77 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC77Q9BR77 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC77Q9BR77 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC77Q9BR77 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC77Q9BR77 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC77Q9BR77 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC77Q9BR77 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC77Q9BR77 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC77Q9BR77 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC77Q9BR77 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms