Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ04

RBM4B, RNA-binding protein 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM4BQ9BQ04 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBM4BQ9BQ04 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBM4BQ9BQ04 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBM4BQ9BQ04 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBM4BQ9BQ04 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBM4BQ9BQ04 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBM4BQ9BQ04 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBM4BQ9BQ04 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBM4BQ9BQ04 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBM4BQ9BQ04 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RBM4BQ9BQ04 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBM4BQ9BQ04 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBM4BQ9BQ04 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBM4BQ9BQ04 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBM4BQ9BQ04 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBM4BQ9BQ04 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBM4BQ9BQ04 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBM4BQ9BQ04 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBM4BQ9BQ04 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBM4BQ9BQ04 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBM4BQ9BQ04 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBM4BQ9BQ04 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM4BQ9BQ04 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM4BQ9BQ04 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM4BQ9BQ04 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM4BQ9BQ04 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM4BQ9BQ04 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM4BQ9BQ04 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM4BQ9BQ04 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM4BQ9BQ04 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM4BQ9BQ04 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM4BQ9BQ04 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM4BQ9BQ04 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM4BQ9BQ04 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM4BQ9BQ04 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM4BQ9BQ04 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM4BQ9BQ04 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBM4BQ9BQ04 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBM4BQ9BQ04 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBM4BQ9BQ04 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBM4BQ9BQ04 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBM4BQ9BQ04 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBM4BQ9BQ04 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM4BQ9BQ04 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM4BQ9BQ04 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM4BQ9BQ04 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM4BQ9BQ04 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM4BQ9BQ04 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM4BQ9BQ04 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM4BQ9BQ04 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM4BQ9BQ04 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM4BQ9BQ04 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM4BQ9BQ04 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM4BQ9BQ04 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM4BQ9BQ04 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM4BQ9BQ04 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM4BQ9BQ04 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM4BQ9BQ04 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM4BQ9BQ04 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RBM4BQ9BQ04 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM4BQ9BQ04 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM4BQ9BQ04 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM4BQ9BQ04 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM4BQ9BQ04 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM4BQ9BQ04 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM4BQ9BQ04 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM4BQ9BQ04 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM4BQ9BQ04 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBM4BQ9BQ04 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBM4BQ9BQ04 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBM4BQ9BQ04 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBM4BQ9BQ04 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBM4BQ9BQ04 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBM4BQ9BQ04 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBM4BQ9BQ04 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBM4BQ9BQ04 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBM4BQ9BQ04 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBM4BQ9BQ04 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBM4BQ9BQ04 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBM4BQ9BQ04 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBM4BQ9BQ04 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBM4BQ9BQ04 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBM4BQ9BQ04 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBM4BQ9BQ04 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBM4BQ9BQ04 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBM4BQ9BQ04 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBM4BQ9BQ04 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBM4BQ9BQ04 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBM4BQ9BQ04 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBM4BQ9BQ04 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBM4BQ9BQ04 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RBM4BQ9BQ04 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBM4BQ9BQ04 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBM4BQ9BQ04 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBM4BQ9BQ04 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBM4BQ9BQ04 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBM4BQ9BQ04 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RBM4BQ9BQ04 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RBM4BQ9BQ04 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBM4BQ9BQ04 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms