Protein–RNA interactions for Protein: Q99961

SH3GL1, Endophilin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL1Q99961 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3GL1Q99961 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3GL1Q99961 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3GL1Q99961 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3GL1Q99961 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3GL1Q99961 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3GL1Q99961 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3GL1Q99961 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3GL1Q99961 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3GL1Q99961 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3GL1Q99961 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3GL1Q99961 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3GL1Q99961 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3GL1Q99961 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3GL1Q99961 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3GL1Q99961 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3GL1Q99961 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3GL1Q99961 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SH3GL1Q99961 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SH3GL1Q99961 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3GL1Q99961 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3GL1Q99961 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3GL1Q99961 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3GL1Q99961 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3GL1Q99961 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3GL1Q99961 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3GL1Q99961 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3GL1Q99961 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3GL1Q99961 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3GL1Q99961 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3GL1Q99961 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3GL1Q99961 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3GL1Q99961 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3GL1Q99961 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3GL1Q99961 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3GL1Q99961 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3GL1Q99961 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3GL1Q99961 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3GL1Q99961 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3GL1Q99961 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3GL1Q99961 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3GL1Q99961 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3GL1Q99961 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3GL1Q99961 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3GL1Q99961 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3GL1Q99961 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3GL1Q99961 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3GL1Q99961 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3GL1Q99961 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3GL1Q99961 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3GL1Q99961 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3GL1Q99961 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3GL1Q99961 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3GL1Q99961 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3GL1Q99961 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3GL1Q99961 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3GL1Q99961 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3GL1Q99961 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3GL1Q99961 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3GL1Q99961 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3GL1Q99961 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3GL1Q99961 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3GL1Q99961 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3GL1Q99961 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3GL1Q99961 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3GL1Q99961 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3GL1Q99961 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3GL1Q99961 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3GL1Q99961 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3GL1Q99961 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3GL1Q99961 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3GL1Q99961 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3GL1Q99961 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3GL1Q99961 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3GL1Q99961 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3GL1Q99961 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3GL1Q99961 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3GL1Q99961 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3GL1Q99961 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3GL1Q99961 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3GL1Q99961 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3GL1Q99961 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3GL1Q99961 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3GL1Q99961 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3GL1Q99961 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3GL1Q99961 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3GL1Q99961 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3GL1Q99961 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3GL1Q99961 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3GL1Q99961 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3GL1Q99961 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3GL1Q99961 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3GL1Q99961 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3GL1Q99961 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3GL1Q99961 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH3GL1Q99961 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH3GL1Q99961 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH3GL1Q99961 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH3GL1Q99961 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH3GL1Q99961 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms