Protein–RNA interactions for Protein: Q99959

PKP2, Plakophilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP2Q99959 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKP2Q99959 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKP2Q99959 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKP2Q99959 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKP2Q99959 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKP2Q99959 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKP2Q99959 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKP2Q99959 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKP2Q99959 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKP2Q99959 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKP2Q99959 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKP2Q99959 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKP2Q99959 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKP2Q99959 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKP2Q99959 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKP2Q99959 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKP2Q99959 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKP2Q99959 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKP2Q99959 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKP2Q99959 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKP2Q99959 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKP2Q99959 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKP2Q99959 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKP2Q99959 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKP2Q99959 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKP2Q99959 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKP2Q99959 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKP2Q99959 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKP2Q99959 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKP2Q99959 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PKP2Q99959 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKP2Q99959 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKP2Q99959 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKP2Q99959 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKP2Q99959 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKP2Q99959 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PKP2Q99959 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PKP2Q99959 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKP2Q99959 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKP2Q99959 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKP2Q99959 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKP2Q99959 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKP2Q99959 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PKP2Q99959 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKP2Q99959 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKP2Q99959 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKP2Q99959 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKP2Q99959 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKP2Q99959 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKP2Q99959 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKP2Q99959 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKP2Q99959 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKP2Q99959 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKP2Q99959 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PKP2Q99959 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKP2Q99959 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKP2Q99959 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKP2Q99959 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKP2Q99959 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKP2Q99959 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKP2Q99959 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PKP2Q99959 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKP2Q99959 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKP2Q99959 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKP2Q99959 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKP2Q99959 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKP2Q99959 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKP2Q99959 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PKP2Q99959 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKP2Q99959 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKP2Q99959 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKP2Q99959 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKP2Q99959 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKP2Q99959 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PKP2Q99959 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKP2Q99959 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKP2Q99959 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKP2Q99959 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKP2Q99959 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKP2Q99959 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKP2Q99959 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKP2Q99959 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKP2Q99959 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKP2Q99959 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKP2Q99959 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKP2Q99959 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKP2Q99959 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PKP2Q99959 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKP2Q99959 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKP2Q99959 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKP2Q99959 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKP2Q99959 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKP2Q99959 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKP2Q99959 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKP2Q99959 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PKP2Q99959 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKP2Q99959 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKP2Q99959 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKP2Q99959 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKP2Q99959 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms