Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DUSP9Q99956 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DUSP9Q99956 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DUSP9Q99956 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DUSP9Q99956 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DUSP9Q99956 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DUSP9Q99956 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DUSP9Q99956 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DUSP9Q99956 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DUSP9Q99956 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DUSP9Q99956 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DUSP9Q99956 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
DUSP9Q99956 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DUSP9Q99956 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DUSP9Q99956 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
DUSP9Q99956 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
DUSP9Q99956 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DUSP9Q99956 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DUSP9Q99956 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DUSP9Q99956 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DUSP9Q99956 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DUSP9Q99956 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DUSP9Q99956 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DUSP9Q99956 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DUSP9Q99956 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DUSP9Q99956 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DUSP9Q99956 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DUSP9Q99956 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DUSP9Q99956 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DUSP9Q99956 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DUSP9Q99956 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DUSP9Q99956 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DUSP9Q99956 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DUSP9Q99956 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DUSP9Q99956 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DUSP9Q99956 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DUSP9Q99956 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DUSP9Q99956 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DUSP9Q99956 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
DUSP9Q99956 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DUSP9Q99956 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DUSP9Q99956 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DUSP9Q99956 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DUSP9Q99956 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DUSP9Q99956 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DUSP9Q99956 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DUSP9Q99956 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DUSP9Q99956 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DUSP9Q99956 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DUSP9Q99956 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
DUSP9Q99956 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
DUSP9Q99956 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
DUSP9Q99956 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DUSP9Q99956 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DUSP9Q99956 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DUSP9Q99956 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
DUSP9Q99956 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DUSP9Q99956 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
DUSP9Q99956 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DUSP9Q99956 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DUSP9Q99956 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
DUSP9Q99956 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
DUSP9Q99956 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
DUSP9Q99956 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DUSP9Q99956 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DUSP9Q99956 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DUSP9Q99956 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DUSP9Q99956 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DUSP9Q99956 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DUSP9Q99956 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
DUSP9Q99956 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DUSP9Q99956 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DUSP9Q99956 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DUSP9Q99956 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DUSP9Q99956 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DUSP9Q99956 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DUSP9Q99956 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DUSP9Q99956 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DUSP9Q99956 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DUSP9Q99956 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
DUSP9Q99956 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DUSP9Q99956 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DUSP9Q99956 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
DUSP9Q99956 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DUSP9Q99956 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DUSP9Q99956 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DUSP9Q99956 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DUSP9Q99956 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DUSP9Q99956 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
DUSP9Q99956 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DUSP9Q99956 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DUSP9Q99956 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DUSP9Q99956 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DUSP9Q99956 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DUSP9Q99956 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DUSP9Q99956 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DUSP9Q99956 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DUSP9Q99956 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DUSP9Q99956 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DUSP9Q99956 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms