Protein–RNA interactions for Protein: Q99613

EIF3C, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CQ99613 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EIF3CQ99613 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EIF3CQ99613 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EIF3CQ99613 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EIF3CQ99613 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EIF3CQ99613 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EIF3CQ99613 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EIF3CQ99613 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
EIF3CQ99613 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EIF3CQ99613 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EIF3CQ99613 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EIF3CQ99613 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EIF3CQ99613 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EIF3CQ99613 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EIF3CQ99613 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EIF3CQ99613 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EIF3CQ99613 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
EIF3CQ99613 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EIF3CQ99613 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EIF3CQ99613 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EIF3CQ99613 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EIF3CQ99613 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EIF3CQ99613 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
EIF3CQ99613 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EIF3CQ99613 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EIF3CQ99613 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EIF3CQ99613 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EIF3CQ99613 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EIF3CQ99613 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EIF3CQ99613 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EIF3CQ99613 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EIF3CQ99613 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EIF3CQ99613 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EIF3CQ99613 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EIF3CQ99613 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EIF3CQ99613 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EIF3CQ99613 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EIF3CQ99613 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EIF3CQ99613 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EIF3CQ99613 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EIF3CQ99613 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EIF3CQ99613 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EIF3CQ99613 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EIF3CQ99613 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EIF3CQ99613 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EIF3CQ99613 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EIF3CQ99613 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EIF3CQ99613 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EIF3CQ99613 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EIF3CQ99613 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EIF3CQ99613 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
EIF3CQ99613 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EIF3CQ99613 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EIF3CQ99613 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EIF3CQ99613 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EIF3CQ99613 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EIF3CQ99613 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EIF3CQ99613 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EIF3CQ99613 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EIF3CQ99613 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EIF3CQ99613 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EIF3CQ99613 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EIF3CQ99613 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EIF3CQ99613 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EIF3CQ99613 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EIF3CQ99613 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EIF3CQ99613 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EIF3CQ99613 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EIF3CQ99613 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EIF3CQ99613 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
EIF3CQ99613 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EIF3CQ99613 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EIF3CQ99613 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EIF3CQ99613 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EIF3CQ99613 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EIF3CQ99613 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EIF3CQ99613 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EIF3CQ99613 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EIF3CQ99613 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EIF3CQ99613 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EIF3CQ99613 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EIF3CQ99613 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EIF3CQ99613 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EIF3CQ99613 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
EIF3CQ99613 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EIF3CQ99613 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EIF3CQ99613 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EIF3CQ99613 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EIF3CQ99613 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EIF3CQ99613 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EIF3CQ99613 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EIF3CQ99613 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EIF3CQ99613 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EIF3CQ99613 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EIF3CQ99613 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EIF3CQ99613 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EIF3CQ99613 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EIF3CQ99613 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EIF3CQ99613 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EIF3CQ99613 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.9 ms