Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDRT15Q96T59 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDRT15Q96T59 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDRT15Q96T59 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDRT15Q96T59 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDRT15Q96T59 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDRT15Q96T59 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDRT15Q96T59 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDRT15Q96T59 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDRT15Q96T59 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDRT15Q96T59 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDRT15Q96T59 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDRT15Q96T59 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDRT15Q96T59 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDRT15Q96T59 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDRT15Q96T59 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDRT15Q96T59 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDRT15Q96T59 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDRT15Q96T59 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDRT15Q96T59 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDRT15Q96T59 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDRT15Q96T59 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDRT15Q96T59 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDRT15Q96T59 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDRT15Q96T59 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDRT15Q96T59 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDRT15Q96T59 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CDRT15Q96T59 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDRT15Q96T59 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDRT15Q96T59 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDRT15Q96T59 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDRT15Q96T59 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDRT15Q96T59 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDRT15Q96T59 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDRT15Q96T59 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDRT15Q96T59 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDRT15Q96T59 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDRT15Q96T59 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDRT15Q96T59 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDRT15Q96T59 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDRT15Q96T59 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDRT15Q96T59 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDRT15Q96T59 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDRT15Q96T59 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDRT15Q96T59 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDRT15Q96T59 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDRT15Q96T59 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDRT15Q96T59 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDRT15Q96T59 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDRT15Q96T59 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDRT15Q96T59 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDRT15Q96T59 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDRT15Q96T59 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDRT15Q96T59 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDRT15Q96T59 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDRT15Q96T59 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDRT15Q96T59 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDRT15Q96T59 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDRT15Q96T59 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDRT15Q96T59 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDRT15Q96T59 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDRT15Q96T59 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDRT15Q96T59 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDRT15Q96T59 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDRT15Q96T59 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDRT15Q96T59 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDRT15Q96T59 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDRT15Q96T59 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDRT15Q96T59 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CDRT15Q96T59 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDRT15Q96T59 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CDRT15Q96T59 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDRT15Q96T59 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDRT15Q96T59 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDRT15Q96T59 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDRT15Q96T59 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDRT15Q96T59 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDRT15Q96T59 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDRT15Q96T59 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDRT15Q96T59 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDRT15Q96T59 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDRT15Q96T59 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDRT15Q96T59 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDRT15Q96T59 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDRT15Q96T59 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDRT15Q96T59 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDRT15Q96T59 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDRT15Q96T59 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDRT15Q96T59 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDRT15Q96T59 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDRT15Q96T59 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CDRT15Q96T59 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDRT15Q96T59 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDRT15Q96T59 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDRT15Q96T59 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDRT15Q96T59 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDRT15Q96T59 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDRT15Q96T59 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDRT15Q96T59 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDRT15Q96T59 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms