Protein–RNA interactions for Protein: Q96SK2

TMEM209, Transmembrane protein 209, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM209Q96SK2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM209Q96SK2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM209Q96SK2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM209Q96SK2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM209Q96SK2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM209Q96SK2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM209Q96SK2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM209Q96SK2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM209Q96SK2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM209Q96SK2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM209Q96SK2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM209Q96SK2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM209Q96SK2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM209Q96SK2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM209Q96SK2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM209Q96SK2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM209Q96SK2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM209Q96SK2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM209Q96SK2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM209Q96SK2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMEM209Q96SK2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TMEM209Q96SK2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMEM209Q96SK2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TMEM209Q96SK2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM209Q96SK2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM209Q96SK2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM209Q96SK2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM209Q96SK2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM209Q96SK2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM209Q96SK2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM209Q96SK2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM209Q96SK2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM209Q96SK2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM209Q96SK2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM209Q96SK2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM209Q96SK2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM209Q96SK2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM209Q96SK2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM209Q96SK2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM209Q96SK2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM209Q96SK2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM209Q96SK2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM209Q96SK2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM209Q96SK2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM209Q96SK2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM209Q96SK2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM209Q96SK2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM209Q96SK2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM209Q96SK2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM209Q96SK2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM209Q96SK2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM209Q96SK2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM209Q96SK2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM209Q96SK2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM209Q96SK2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM209Q96SK2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM209Q96SK2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM209Q96SK2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM209Q96SK2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM209Q96SK2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM209Q96SK2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM209Q96SK2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM209Q96SK2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM209Q96SK2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM209Q96SK2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM209Q96SK2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM209Q96SK2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM209Q96SK2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM209Q96SK2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM209Q96SK2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM209Q96SK2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM209Q96SK2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM209Q96SK2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM209Q96SK2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM209Q96SK2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM209Q96SK2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM209Q96SK2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM209Q96SK2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM209Q96SK2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM209Q96SK2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM209Q96SK2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM209Q96SK2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM209Q96SK2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM209Q96SK2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM209Q96SK2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM209Q96SK2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM209Q96SK2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM209Q96SK2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM209Q96SK2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM209Q96SK2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM209Q96SK2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TMEM209Q96SK2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TMEM209Q96SK2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM209Q96SK2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM209Q96SK2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM209Q96SK2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM209Q96SK2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM209Q96SK2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM209Q96SK2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM209Q96SK2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms