Protein–RNA interactions for Protein: Q96NE9

FRMD6, FERM domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD6Q96NE9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMD6Q96NE9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMD6Q96NE9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMD6Q96NE9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMD6Q96NE9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMD6Q96NE9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMD6Q96NE9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMD6Q96NE9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMD6Q96NE9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMD6Q96NE9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMD6Q96NE9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMD6Q96NE9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMD6Q96NE9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMD6Q96NE9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMD6Q96NE9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMD6Q96NE9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMD6Q96NE9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRMD6Q96NE9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMD6Q96NE9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMD6Q96NE9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMD6Q96NE9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMD6Q96NE9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMD6Q96NE9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FRMD6Q96NE9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FRMD6Q96NE9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FRMD6Q96NE9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FRMD6Q96NE9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FRMD6Q96NE9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FRMD6Q96NE9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FRMD6Q96NE9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FRMD6Q96NE9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FRMD6Q96NE9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FRMD6Q96NE9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FRMD6Q96NE9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FRMD6Q96NE9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FRMD6Q96NE9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FRMD6Q96NE9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FRMD6Q96NE9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FRMD6Q96NE9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FRMD6Q96NE9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FRMD6Q96NE9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FRMD6Q96NE9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FRMD6Q96NE9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FRMD6Q96NE9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FRMD6Q96NE9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FRMD6Q96NE9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FRMD6Q96NE9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FRMD6Q96NE9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FRMD6Q96NE9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FRMD6Q96NE9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FRMD6Q96NE9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FRMD6Q96NE9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FRMD6Q96NE9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FRMD6Q96NE9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FRMD6Q96NE9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FRMD6Q96NE9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FRMD6Q96NE9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FRMD6Q96NE9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FRMD6Q96NE9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FRMD6Q96NE9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FRMD6Q96NE9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FRMD6Q96NE9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FRMD6Q96NE9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FRMD6Q96NE9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FRMD6Q96NE9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FRMD6Q96NE9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FRMD6Q96NE9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FRMD6Q96NE9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FRMD6Q96NE9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FRMD6Q96NE9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FRMD6Q96NE9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FRMD6Q96NE9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FRMD6Q96NE9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FRMD6Q96NE9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FRMD6Q96NE9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FRMD6Q96NE9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FRMD6Q96NE9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FRMD6Q96NE9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FRMD6Q96NE9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FRMD6Q96NE9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FRMD6Q96NE9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FRMD6Q96NE9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FRMD6Q96NE9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FRMD6Q96NE9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FRMD6Q96NE9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FRMD6Q96NE9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FRMD6Q96NE9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FRMD6Q96NE9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FRMD6Q96NE9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FRMD6Q96NE9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FRMD6Q96NE9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FRMD6Q96NE9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FRMD6Q96NE9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FRMD6Q96NE9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FRMD6Q96NE9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FRMD6Q96NE9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FRMD6Q96NE9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FRMD6Q96NE9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FRMD6Q96NE9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FRMD6Q96NE9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms