Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA2

RILP, Rab-interacting lysosomal protein, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RILPQ96NA2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RILPQ96NA2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RILPQ96NA2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RILPQ96NA2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RILPQ96NA2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RILPQ96NA2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RILPQ96NA2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RILPQ96NA2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RILPQ96NA2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RILPQ96NA2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RILPQ96NA2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RILPQ96NA2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RILPQ96NA2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RILPQ96NA2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RILPQ96NA2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RILPQ96NA2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RILPQ96NA2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RILPQ96NA2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RILPQ96NA2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RILPQ96NA2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RILPQ96NA2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RILPQ96NA2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RILPQ96NA2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RILPQ96NA2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RILPQ96NA2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RILPQ96NA2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RILPQ96NA2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RILPQ96NA2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RILPQ96NA2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RILPQ96NA2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RILPQ96NA2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RILPQ96NA2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RILPQ96NA2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RILPQ96NA2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RILPQ96NA2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RILPQ96NA2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RILPQ96NA2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RILPQ96NA2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RILPQ96NA2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RILPQ96NA2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RILPQ96NA2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RILPQ96NA2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RILPQ96NA2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RILPQ96NA2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RILPQ96NA2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RILPQ96NA2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RILPQ96NA2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RILPQ96NA2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RILPQ96NA2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RILPQ96NA2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RILPQ96NA2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RILPQ96NA2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RILPQ96NA2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RILPQ96NA2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RILPQ96NA2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RILPQ96NA2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RILPQ96NA2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RILPQ96NA2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RILPQ96NA2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RILPQ96NA2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RILPQ96NA2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RILPQ96NA2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RILPQ96NA2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RILPQ96NA2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RILPQ96NA2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RILPQ96NA2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RILPQ96NA2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RILPQ96NA2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RILPQ96NA2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RILPQ96NA2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RILPQ96NA2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RILPQ96NA2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RILPQ96NA2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RILPQ96NA2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RILPQ96NA2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RILPQ96NA2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RILPQ96NA2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RILPQ96NA2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RILPQ96NA2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RILPQ96NA2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RILPQ96NA2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RILPQ96NA2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RILPQ96NA2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RILPQ96NA2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RILPQ96NA2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RILPQ96NA2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RILPQ96NA2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RILPQ96NA2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RILPQ96NA2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RILPQ96NA2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RILPQ96NA2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RILPQ96NA2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RILPQ96NA2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RILPQ96NA2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RILPQ96NA2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RILPQ96NA2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RILPQ96NA2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RILPQ96NA2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RILPQ96NA2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RILPQ96NA2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.1 ms