Protein–RNA interactions for Protein: Q96N95

ZNF396, Zinc finger protein 396, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF396Q96N95 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF396Q96N95 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF396Q96N95 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF396Q96N95 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF396Q96N95 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF396Q96N95 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF396Q96N95 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF396Q96N95 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF396Q96N95 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF396Q96N95 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF396Q96N95 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF396Q96N95 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF396Q96N95 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF396Q96N95 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF396Q96N95 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF396Q96N95 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF396Q96N95 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF396Q96N95 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF396Q96N95 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF396Q96N95 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF396Q96N95 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF396Q96N95 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF396Q96N95 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF396Q96N95 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF396Q96N95 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF396Q96N95 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF396Q96N95 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF396Q96N95 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF396Q96N95 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF396Q96N95 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF396Q96N95 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF396Q96N95 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF396Q96N95 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF396Q96N95 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF396Q96N95 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF396Q96N95 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF396Q96N95 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF396Q96N95 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF396Q96N95 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF396Q96N95 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF396Q96N95 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF396Q96N95 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF396Q96N95 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF396Q96N95 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF396Q96N95 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF396Q96N95 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF396Q96N95 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF396Q96N95 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF396Q96N95 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF396Q96N95 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF396Q96N95 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF396Q96N95 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF396Q96N95 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF396Q96N95 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF396Q96N95 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF396Q96N95 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF396Q96N95 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF396Q96N95 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF396Q96N95 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF396Q96N95 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF396Q96N95 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF396Q96N95 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF396Q96N95 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF396Q96N95 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF396Q96N95 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF396Q96N95 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF396Q96N95 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF396Q96N95 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF396Q96N95 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF396Q96N95 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF396Q96N95 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF396Q96N95 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF396Q96N95 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF396Q96N95 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF396Q96N95 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF396Q96N95 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF396Q96N95 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF396Q96N95 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF396Q96N95 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF396Q96N95 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF396Q96N95 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZNF396Q96N95 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ZNF396Q96N95 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZNF396Q96N95 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZNF396Q96N95 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZNF396Q96N95 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF396Q96N95 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF396Q96N95 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF396Q96N95 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF396Q96N95 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF396Q96N95 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF396Q96N95 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF396Q96N95 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF396Q96N95 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF396Q96N95 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF396Q96N95 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF396Q96N95 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF396Q96N95 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF396Q96N95 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF396Q96N95 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms