Protein–RNA interactions for Protein: Q96N03

VSTM2L, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2LQ96N03 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VSTM2LQ96N03 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VSTM2LQ96N03 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VSTM2LQ96N03 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VSTM2LQ96N03 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VSTM2LQ96N03 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VSTM2LQ96N03 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VSTM2LQ96N03 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VSTM2LQ96N03 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VSTM2LQ96N03 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
VSTM2LQ96N03 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VSTM2LQ96N03 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VSTM2LQ96N03 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VSTM2LQ96N03 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VSTM2LQ96N03 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VSTM2LQ96N03 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VSTM2LQ96N03 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VSTM2LQ96N03 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VSTM2LQ96N03 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VSTM2LQ96N03 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VSTM2LQ96N03 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VSTM2LQ96N03 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VSTM2LQ96N03 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VSTM2LQ96N03 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VSTM2LQ96N03 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VSTM2LQ96N03 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VSTM2LQ96N03 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VSTM2LQ96N03 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VSTM2LQ96N03 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VSTM2LQ96N03 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VSTM2LQ96N03 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VSTM2LQ96N03 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VSTM2LQ96N03 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VSTM2LQ96N03 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
VSTM2LQ96N03 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VSTM2LQ96N03 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VSTM2LQ96N03 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VSTM2LQ96N03 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VSTM2LQ96N03 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VSTM2LQ96N03 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VSTM2LQ96N03 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VSTM2LQ96N03 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VSTM2LQ96N03 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VSTM2LQ96N03 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VSTM2LQ96N03 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VSTM2LQ96N03 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VSTM2LQ96N03 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VSTM2LQ96N03 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VSTM2LQ96N03 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VSTM2LQ96N03 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VSTM2LQ96N03 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VSTM2LQ96N03 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VSTM2LQ96N03 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VSTM2LQ96N03 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VSTM2LQ96N03 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VSTM2LQ96N03 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VSTM2LQ96N03 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VSTM2LQ96N03 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VSTM2LQ96N03 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VSTM2LQ96N03 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VSTM2LQ96N03 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VSTM2LQ96N03 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VSTM2LQ96N03 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VSTM2LQ96N03 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VSTM2LQ96N03 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VSTM2LQ96N03 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VSTM2LQ96N03 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VSTM2LQ96N03 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VSTM2LQ96N03 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VSTM2LQ96N03 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VSTM2LQ96N03 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VSTM2LQ96N03 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VSTM2LQ96N03 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VSTM2LQ96N03 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VSTM2LQ96N03 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VSTM2LQ96N03 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VSTM2LQ96N03 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VSTM2LQ96N03 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VSTM2LQ96N03 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VSTM2LQ96N03 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VSTM2LQ96N03 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VSTM2LQ96N03 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VSTM2LQ96N03 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VSTM2LQ96N03 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VSTM2LQ96N03 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VSTM2LQ96N03 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VSTM2LQ96N03 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VSTM2LQ96N03 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VSTM2LQ96N03 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VSTM2LQ96N03 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VSTM2LQ96N03 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VSTM2LQ96N03 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VSTM2LQ96N03 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
VSTM2LQ96N03 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VSTM2LQ96N03 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VSTM2LQ96N03 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VSTM2LQ96N03 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VSTM2LQ96N03 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VSTM2LQ96N03 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VSTM2LQ96N03 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms