Protein–RNA interactions for Protein: Q96MT1

RNF145, RING finger protein 145, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF145Q96MT1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF145Q96MT1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF145Q96MT1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF145Q96MT1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF145Q96MT1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF145Q96MT1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF145Q96MT1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF145Q96MT1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF145Q96MT1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF145Q96MT1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF145Q96MT1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF145Q96MT1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF145Q96MT1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF145Q96MT1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF145Q96MT1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF145Q96MT1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF145Q96MT1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF145Q96MT1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF145Q96MT1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF145Q96MT1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF145Q96MT1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF145Q96MT1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF145Q96MT1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF145Q96MT1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF145Q96MT1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF145Q96MT1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF145Q96MT1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF145Q96MT1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF145Q96MT1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF145Q96MT1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF145Q96MT1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF145Q96MT1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF145Q96MT1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF145Q96MT1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF145Q96MT1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF145Q96MT1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF145Q96MT1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF145Q96MT1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF145Q96MT1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF145Q96MT1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF145Q96MT1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF145Q96MT1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF145Q96MT1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF145Q96MT1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF145Q96MT1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF145Q96MT1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF145Q96MT1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF145Q96MT1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF145Q96MT1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF145Q96MT1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF145Q96MT1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF145Q96MT1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF145Q96MT1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF145Q96MT1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF145Q96MT1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF145Q96MT1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF145Q96MT1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF145Q96MT1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF145Q96MT1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF145Q96MT1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF145Q96MT1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF145Q96MT1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF145Q96MT1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF145Q96MT1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF145Q96MT1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF145Q96MT1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF145Q96MT1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF145Q96MT1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF145Q96MT1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF145Q96MT1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF145Q96MT1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF145Q96MT1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF145Q96MT1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF145Q96MT1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF145Q96MT1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF145Q96MT1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF145Q96MT1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF145Q96MT1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF145Q96MT1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF145Q96MT1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF145Q96MT1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF145Q96MT1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF145Q96MT1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF145Q96MT1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF145Q96MT1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF145Q96MT1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF145Q96MT1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF145Q96MT1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF145Q96MT1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF145Q96MT1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF145Q96MT1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF145Q96MT1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF145Q96MT1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF145Q96MT1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF145Q96MT1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF145Q96MT1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF145Q96MT1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF145Q96MT1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF145Q96MT1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF145Q96MT1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms