Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC17Q96LX7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC17Q96LX7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC17Q96LX7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC17Q96LX7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC17Q96LX7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC17Q96LX7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC17Q96LX7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC17Q96LX7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC17Q96LX7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC17Q96LX7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC17Q96LX7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC17Q96LX7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC17Q96LX7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC17Q96LX7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC17Q96LX7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC17Q96LX7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC17Q96LX7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC17Q96LX7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC17Q96LX7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC17Q96LX7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC17Q96LX7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC17Q96LX7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC17Q96LX7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC17Q96LX7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC17Q96LX7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC17Q96LX7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC17Q96LX7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC17Q96LX7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC17Q96LX7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC17Q96LX7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC17Q96LX7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC17Q96LX7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC17Q96LX7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC17Q96LX7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC17Q96LX7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC17Q96LX7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC17Q96LX7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC17Q96LX7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC17Q96LX7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC17Q96LX7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC17Q96LX7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC17Q96LX7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC17Q96LX7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC17Q96LX7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC17Q96LX7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC17Q96LX7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC17Q96LX7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC17Q96LX7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC17Q96LX7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC17Q96LX7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC17Q96LX7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC17Q96LX7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC17Q96LX7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC17Q96LX7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC17Q96LX7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC17Q96LX7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC17Q96LX7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC17Q96LX7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC17Q96LX7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC17Q96LX7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC17Q96LX7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC17Q96LX7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC17Q96LX7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC17Q96LX7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC17Q96LX7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC17Q96LX7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC17Q96LX7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC17Q96LX7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC17Q96LX7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC17Q96LX7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC17Q96LX7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC17Q96LX7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC17Q96LX7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC17Q96LX7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC17Q96LX7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC17Q96LX7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC17Q96LX7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC17Q96LX7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC17Q96LX7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC17Q96LX7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC17Q96LX7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC17Q96LX7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC17Q96LX7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC17Q96LX7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC17Q96LX7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC17Q96LX7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC17Q96LX7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC17Q96LX7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC17Q96LX7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC17Q96LX7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC17Q96LX7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC17Q96LX7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC17Q96LX7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC17Q96LX7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC17Q96LX7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC17Q96LX7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC17Q96LX7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC17Q96LX7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC17Q96LX7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms