Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN2

CNDP1, Beta-Ala-His dipeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNDP1Q96KN2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNDP1Q96KN2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNDP1Q96KN2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNDP1Q96KN2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNDP1Q96KN2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNDP1Q96KN2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNDP1Q96KN2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNDP1Q96KN2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNDP1Q96KN2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNDP1Q96KN2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNDP1Q96KN2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNDP1Q96KN2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNDP1Q96KN2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNDP1Q96KN2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNDP1Q96KN2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNDP1Q96KN2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNDP1Q96KN2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNDP1Q96KN2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNDP1Q96KN2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNDP1Q96KN2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNDP1Q96KN2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNDP1Q96KN2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CNDP1Q96KN2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNDP1Q96KN2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CNDP1Q96KN2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNDP1Q96KN2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CNDP1Q96KN2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNDP1Q96KN2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CNDP1Q96KN2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNDP1Q96KN2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CNDP1Q96KN2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CNDP1Q96KN2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CNDP1Q96KN2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CNDP1Q96KN2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CNDP1Q96KN2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CNDP1Q96KN2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNDP1Q96KN2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNDP1Q96KN2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNDP1Q96KN2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNDP1Q96KN2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNDP1Q96KN2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNDP1Q96KN2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CNDP1Q96KN2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNDP1Q96KN2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CNDP1Q96KN2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNDP1Q96KN2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNDP1Q96KN2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNDP1Q96KN2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNDP1Q96KN2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNDP1Q96KN2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNDP1Q96KN2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNDP1Q96KN2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNDP1Q96KN2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNDP1Q96KN2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNDP1Q96KN2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNDP1Q96KN2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNDP1Q96KN2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNDP1Q96KN2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNDP1Q96KN2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CNDP1Q96KN2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNDP1Q96KN2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNDP1Q96KN2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNDP1Q96KN2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNDP1Q96KN2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNDP1Q96KN2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CNDP1Q96KN2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNDP1Q96KN2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNDP1Q96KN2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CNDP1Q96KN2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNDP1Q96KN2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNDP1Q96KN2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CNDP1Q96KN2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNDP1Q96KN2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNDP1Q96KN2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNDP1Q96KN2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNDP1Q96KN2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNDP1Q96KN2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNDP1Q96KN2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNDP1Q96KN2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNDP1Q96KN2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNDP1Q96KN2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNDP1Q96KN2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNDP1Q96KN2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNDP1Q96KN2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNDP1Q96KN2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNDP1Q96KN2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNDP1Q96KN2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNDP1Q96KN2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNDP1Q96KN2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNDP1Q96KN2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNDP1Q96KN2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CNDP1Q96KN2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CNDP1Q96KN2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNDP1Q96KN2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNDP1Q96KN2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNDP1Q96KN2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNDP1Q96KN2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNDP1Q96KN2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNDP1Q96KN2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNDP1Q96KN2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms