Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
ABCC12Q96J65 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
ABCC12Q96J65 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
ABCC12Q96J65 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
ABCC12Q96J65 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
ABCC12Q96J65 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
ABCC12Q96J65 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
ABCC12Q96J65 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
ABCC12Q96J65 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
ABCC12Q96J65 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
ABCC12Q96J65 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
ABCC12Q96J65 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
ABCC12Q96J65 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
ABCC12Q96J65 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
ABCC12Q96J65 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ABCC12Q96J65 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
ABCC12Q96J65 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
ABCC12Q96J65 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
ABCC12Q96J65 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ABCC12Q96J65 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
ABCC12Q96J65 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
ABCC12Q96J65 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
ABCC12Q96J65 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
ABCC12Q96J65 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
ABCC12Q96J65 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ABCC12Q96J65 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
ABCC12Q96J65 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
ABCC12Q96J65 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
ABCC12Q96J65 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
ABCC12Q96J65 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
ABCC12Q96J65 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
ABCC12Q96J65 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ABCC12Q96J65 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC31.16■■■□□ 2.58
ABCC12Q96J65 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
ABCC12Q96J65 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
ABCC12Q96J65 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ABCC12Q96J65 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
ABCC12Q96J65 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ABCC12Q96J65 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
ABCC12Q96J65 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
ABCC12Q96J65 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
ABCC12Q96J65 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
ABCC12Q96J65 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
ABCC12Q96J65 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC31.13■■■□□ 2.57
ABCC12Q96J65 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
ABCC12Q96J65 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
ABCC12Q96J65 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ABCC12Q96J65 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ABCC12Q96J65 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ABCC12Q96J65 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ABCC12Q96J65 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ABCC12Q96J65 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ABCC12Q96J65 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
ABCC12Q96J65 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ABCC12Q96J65 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ABCC12Q96J65 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ABCC12Q96J65 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ABCC12Q96J65 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ABCC12Q96J65 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ABCC12Q96J65 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ABCC12Q96J65 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ABCC12Q96J65 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ABCC12Q96J65 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ABCC12Q96J65 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ABCC12Q96J65 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ABCC12Q96J65 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
ABCC12Q96J65 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
ABCC12Q96J65 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ABCC12Q96J65 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ABCC12Q96J65 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ABCC12Q96J65 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ABCC12Q96J65 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ABCC12Q96J65 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ABCC12Q96J65 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ABCC12Q96J65 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ABCC12Q96J65 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ABCC12Q96J65 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ABCC12Q96J65 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ABCC12Q96J65 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ABCC12Q96J65 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ABCC12Q96J65 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ABCC12Q96J65 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ABCC12Q96J65 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ABCC12Q96J65 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ABCC12Q96J65 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ABCC12Q96J65 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ABCC12Q96J65 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
ABCC12Q96J65 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
ABCC12Q96J65 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ABCC12Q96J65 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ABCC12Q96J65 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ABCC12Q96J65 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ABCC12Q96J65 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
ABCC12Q96J65 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ABCC12Q96J65 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ABCC12Q96J65 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
ABCC12Q96J65 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
ABCC12Q96J65 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC31■■■□□ 2.55
ABCC12Q96J65 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC31■■■□□ 2.55
ABCC12Q96J65 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms