Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHDQ96IW2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHDQ96IW2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHDQ96IW2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHDQ96IW2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHDQ96IW2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHDQ96IW2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SHDQ96IW2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHDQ96IW2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHDQ96IW2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHDQ96IW2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SHDQ96IW2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHDQ96IW2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHDQ96IW2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHDQ96IW2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHDQ96IW2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHDQ96IW2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHDQ96IW2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHDQ96IW2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHDQ96IW2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SHDQ96IW2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SHDQ96IW2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SHDQ96IW2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SHDQ96IW2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SHDQ96IW2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SHDQ96IW2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SHDQ96IW2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SHDQ96IW2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SHDQ96IW2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SHDQ96IW2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SHDQ96IW2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SHDQ96IW2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHDQ96IW2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHDQ96IW2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHDQ96IW2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHDQ96IW2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHDQ96IW2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHDQ96IW2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHDQ96IW2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHDQ96IW2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHDQ96IW2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHDQ96IW2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHDQ96IW2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHDQ96IW2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHDQ96IW2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHDQ96IW2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHDQ96IW2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SHDQ96IW2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SHDQ96IW2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHDQ96IW2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHDQ96IW2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHDQ96IW2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHDQ96IW2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHDQ96IW2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SHDQ96IW2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHDQ96IW2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHDQ96IW2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHDQ96IW2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHDQ96IW2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHDQ96IW2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHDQ96IW2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHDQ96IW2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHDQ96IW2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHDQ96IW2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHDQ96IW2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHDQ96IW2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHDQ96IW2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHDQ96IW2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHDQ96IW2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHDQ96IW2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHDQ96IW2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHDQ96IW2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHDQ96IW2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHDQ96IW2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHDQ96IW2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHDQ96IW2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHDQ96IW2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHDQ96IW2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SHDQ96IW2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHDQ96IW2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHDQ96IW2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHDQ96IW2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHDQ96IW2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHDQ96IW2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHDQ96IW2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHDQ96IW2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHDQ96IW2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHDQ96IW2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHDQ96IW2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHDQ96IW2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHDQ96IW2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHDQ96IW2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHDQ96IW2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHDQ96IW2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHDQ96IW2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHDQ96IW2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHDQ96IW2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHDQ96IW2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHDQ96IW2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHDQ96IW2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms