Protein–RNA interactions for Protein: Q96IQ7

VSIG2, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG2Q96IQ7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VSIG2Q96IQ7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VSIG2Q96IQ7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VSIG2Q96IQ7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VSIG2Q96IQ7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VSIG2Q96IQ7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VSIG2Q96IQ7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VSIG2Q96IQ7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VSIG2Q96IQ7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VSIG2Q96IQ7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VSIG2Q96IQ7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VSIG2Q96IQ7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VSIG2Q96IQ7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VSIG2Q96IQ7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VSIG2Q96IQ7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VSIG2Q96IQ7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VSIG2Q96IQ7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VSIG2Q96IQ7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VSIG2Q96IQ7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VSIG2Q96IQ7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
VSIG2Q96IQ7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VSIG2Q96IQ7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VSIG2Q96IQ7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VSIG2Q96IQ7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VSIG2Q96IQ7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VSIG2Q96IQ7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VSIG2Q96IQ7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VSIG2Q96IQ7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
VSIG2Q96IQ7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VSIG2Q96IQ7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VSIG2Q96IQ7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VSIG2Q96IQ7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VSIG2Q96IQ7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VSIG2Q96IQ7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VSIG2Q96IQ7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VSIG2Q96IQ7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VSIG2Q96IQ7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VSIG2Q96IQ7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VSIG2Q96IQ7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VSIG2Q96IQ7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VSIG2Q96IQ7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VSIG2Q96IQ7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VSIG2Q96IQ7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VSIG2Q96IQ7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VSIG2Q96IQ7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VSIG2Q96IQ7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VSIG2Q96IQ7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VSIG2Q96IQ7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VSIG2Q96IQ7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VSIG2Q96IQ7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VSIG2Q96IQ7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VSIG2Q96IQ7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VSIG2Q96IQ7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VSIG2Q96IQ7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VSIG2Q96IQ7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VSIG2Q96IQ7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VSIG2Q96IQ7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VSIG2Q96IQ7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VSIG2Q96IQ7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VSIG2Q96IQ7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
VSIG2Q96IQ7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VSIG2Q96IQ7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VSIG2Q96IQ7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VSIG2Q96IQ7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
VSIG2Q96IQ7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VSIG2Q96IQ7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VSIG2Q96IQ7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VSIG2Q96IQ7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VSIG2Q96IQ7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VSIG2Q96IQ7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VSIG2Q96IQ7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VSIG2Q96IQ7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VSIG2Q96IQ7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
VSIG2Q96IQ7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VSIG2Q96IQ7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VSIG2Q96IQ7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VSIG2Q96IQ7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VSIG2Q96IQ7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VSIG2Q96IQ7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VSIG2Q96IQ7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VSIG2Q96IQ7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VSIG2Q96IQ7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VSIG2Q96IQ7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VSIG2Q96IQ7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VSIG2Q96IQ7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VSIG2Q96IQ7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VSIG2Q96IQ7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VSIG2Q96IQ7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VSIG2Q96IQ7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VSIG2Q96IQ7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VSIG2Q96IQ7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VSIG2Q96IQ7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VSIG2Q96IQ7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VSIG2Q96IQ7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VSIG2Q96IQ7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VSIG2Q96IQ7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VSIG2Q96IQ7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VSIG2Q96IQ7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VSIG2Q96IQ7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VSIG2Q96IQ7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms