Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MS4A3Q96HJ5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MS4A3Q96HJ5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MS4A3Q96HJ5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MS4A3Q96HJ5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MS4A3Q96HJ5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MS4A3Q96HJ5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MS4A3Q96HJ5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MS4A3Q96HJ5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MS4A3Q96HJ5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MS4A3Q96HJ5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MS4A3Q96HJ5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MS4A3Q96HJ5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MS4A3Q96HJ5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MS4A3Q96HJ5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MS4A3Q96HJ5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MS4A3Q96HJ5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MS4A3Q96HJ5 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MS4A3Q96HJ5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MS4A3Q96HJ5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MS4A3Q96HJ5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MS4A3Q96HJ5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MS4A3Q96HJ5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MS4A3Q96HJ5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MS4A3Q96HJ5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MS4A3Q96HJ5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MS4A3Q96HJ5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MS4A3Q96HJ5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MS4A3Q96HJ5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MS4A3Q96HJ5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MS4A3Q96HJ5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MS4A3Q96HJ5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MS4A3Q96HJ5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MS4A3Q96HJ5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MS4A3Q96HJ5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MS4A3Q96HJ5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A3Q96HJ5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A3Q96HJ5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A3Q96HJ5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A3Q96HJ5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A3Q96HJ5 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A3Q96HJ5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A3Q96HJ5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A3Q96HJ5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A3Q96HJ5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A3Q96HJ5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A3Q96HJ5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A3Q96HJ5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A3Q96HJ5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A3Q96HJ5 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A3Q96HJ5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A3Q96HJ5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A3Q96HJ5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A3Q96HJ5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A3Q96HJ5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A3Q96HJ5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A3Q96HJ5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A3Q96HJ5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A3Q96HJ5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A3Q96HJ5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A3Q96HJ5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A3Q96HJ5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MS4A3Q96HJ5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MS4A3Q96HJ5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MS4A3Q96HJ5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MS4A3Q96HJ5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MS4A3Q96HJ5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MS4A3Q96HJ5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MS4A3Q96HJ5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MS4A3Q96HJ5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MS4A3Q96HJ5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MS4A3Q96HJ5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MS4A3Q96HJ5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MS4A3Q96HJ5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MS4A3Q96HJ5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MS4A3Q96HJ5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MS4A3Q96HJ5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MS4A3Q96HJ5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MS4A3Q96HJ5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MS4A3Q96HJ5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MS4A3Q96HJ5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MS4A3Q96HJ5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MS4A3Q96HJ5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MS4A3Q96HJ5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MS4A3Q96HJ5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MS4A3Q96HJ5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MS4A3Q96HJ5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MS4A3Q96HJ5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MS4A3Q96HJ5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MS4A3Q96HJ5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MS4A3Q96HJ5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MS4A3Q96HJ5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MS4A3Q96HJ5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MS4A3Q96HJ5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MS4A3Q96HJ5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MS4A3Q96HJ5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MS4A3Q96HJ5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MS4A3Q96HJ5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MS4A3Q96HJ5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MS4A3Q96HJ5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms