Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY0

ZC2HC1A, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1AQ96GY0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZC2HC1AQ96GY0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZC2HC1AQ96GY0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZC2HC1AQ96GY0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZC2HC1AQ96GY0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZC2HC1AQ96GY0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZC2HC1AQ96GY0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZC2HC1AQ96GY0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZC2HC1AQ96GY0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZC2HC1AQ96GY0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZC2HC1AQ96GY0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZC2HC1AQ96GY0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZC2HC1AQ96GY0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZC2HC1AQ96GY0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZC2HC1AQ96GY0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZC2HC1AQ96GY0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZC2HC1AQ96GY0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZC2HC1AQ96GY0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZC2HC1AQ96GY0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZC2HC1AQ96GY0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZC2HC1AQ96GY0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZC2HC1AQ96GY0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZC2HC1AQ96GY0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZC2HC1AQ96GY0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZC2HC1AQ96GY0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZC2HC1AQ96GY0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZC2HC1AQ96GY0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZC2HC1AQ96GY0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZC2HC1AQ96GY0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZC2HC1AQ96GY0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZC2HC1AQ96GY0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZC2HC1AQ96GY0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZC2HC1AQ96GY0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZC2HC1AQ96GY0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZC2HC1AQ96GY0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZC2HC1AQ96GY0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZC2HC1AQ96GY0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZC2HC1AQ96GY0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZC2HC1AQ96GY0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ZC2HC1AQ96GY0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZC2HC1AQ96GY0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZC2HC1AQ96GY0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZC2HC1AQ96GY0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZC2HC1AQ96GY0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZC2HC1AQ96GY0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZC2HC1AQ96GY0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZC2HC1AQ96GY0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZC2HC1AQ96GY0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZC2HC1AQ96GY0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ZC2HC1AQ96GY0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZC2HC1AQ96GY0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZC2HC1AQ96GY0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZC2HC1AQ96GY0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZC2HC1AQ96GY0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZC2HC1AQ96GY0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZC2HC1AQ96GY0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZC2HC1AQ96GY0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZC2HC1AQ96GY0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZC2HC1AQ96GY0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZC2HC1AQ96GY0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZC2HC1AQ96GY0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZC2HC1AQ96GY0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZC2HC1AQ96GY0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZC2HC1AQ96GY0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZC2HC1AQ96GY0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZC2HC1AQ96GY0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZC2HC1AQ96GY0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZC2HC1AQ96GY0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZC2HC1AQ96GY0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZC2HC1AQ96GY0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZC2HC1AQ96GY0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZC2HC1AQ96GY0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZC2HC1AQ96GY0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZC2HC1AQ96GY0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZC2HC1AQ96GY0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZC2HC1AQ96GY0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZC2HC1AQ96GY0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZC2HC1AQ96GY0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZC2HC1AQ96GY0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZC2HC1AQ96GY0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZC2HC1AQ96GY0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZC2HC1AQ96GY0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZC2HC1AQ96GY0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZC2HC1AQ96GY0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZC2HC1AQ96GY0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZC2HC1AQ96GY0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZC2HC1AQ96GY0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZC2HC1AQ96GY0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZC2HC1AQ96GY0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZC2HC1AQ96GY0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZC2HC1AQ96GY0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZC2HC1AQ96GY0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZC2HC1AQ96GY0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZC2HC1AQ96GY0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZC2HC1AQ96GY0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZC2HC1AQ96GY0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms